התנועה להגינות שלטונית הגישה (ב', 19.6.2006) עתירה לבג"צ בדרישה להורות על ניהול פרוטוקולים מסודרים ומדוייקים של דיוני הנערכים בפני בית המשפט העליון. בעתירה טענו אנשי התנועה, כי עיקרון השקיפות ופומביות הדיון מחייבות רישום פרוטוקול מדוייק של הדיונים.
את העתירה הגישה התנועה באמצעות יושב-ראשה מרדכי אייזנברג, והיא דורשת משר המשפטים חיים רמון, מנשיא בית המשפט העליון, אהרן ברק, וממנהל בתי המשפט בועז אוקון, להורות על ניהול פרוטוקול בדיוני בית המשפט העליון. לטענת אנשי העמותה, בניגוד לנוהג בדיונים בבתי משפט ובתי דין אחרים במדינה, לא נערכים פרוטוקולים בדיונים הנערכים בבית המשפט העליון, ואין "תיעוד מדוקדק ובעל תוקף מחייב" של הדיונים.
התנועה טוענת בעתירתה, כי שיטת המשפט הישראלית והנורמות הנהוגות בה מחייבות רישום פרוטוקולים של הדיונים, בשל עיקרון השקיפות ופומביות הדיון. לטענת התנועה, יש לקבוע חובת רישום פרוטוקול כחלק מזכות הציבור לדעת, בשל הצורך בחשיפת האמת ושקיפות פעילותו של הגוף הציבורי כדי לאפשר ביקורת ציבורית ומשפטית הולמת על בית המשפט העליון.
בנוסף, מתרעמים אנשי התנועה על העובדה שכיום גובה מזכירות ביהמ"ש העליון "אגרת פרוטוקול" בהליכים המתנהלים בבית המשפט העליון - שעה שפורטוקול שכזה כלל אינו מנוהל.
שר המשפטים, חיים רמון, התבטא לאחרונה בנושא חסרונם של פרוקטולים - אך בדבריו התייחס לפרוטוקולים שאינם מנוהלים על-ידי הוועדה למינוי שופטים. לדבריו, בסירוב לקיום פרוטוקול "יש היגיון", משום שברגע שיש פרוטוקול אדם "לא מדבר באופן חופשי". עם זאת, ציין רמון, כי "יצטרכו לשכנע אותו" מדוע לא לקיים נוהל של רישום פרוטוקולים בדיוני הוועדה למינוי שופטים.
האם דיוני בית המשפט העליון יעברו בקרוב "מהפכת פרוטוקול", ומה שטוב לדעתו של רמון יהיה תקף גם בבית המשפט העליון? את התשובה נדע, מן הסתם, בקרוב. את החלטה בנושא יקבלו שופטי בג"צ בעצמם, שיחליטו האם "לגזור" על עצמם את קיום פרוטוקול.