בג"צ, בהרכב השופטים אהרן ברק, סלים ג'ובראן ואסתר חיות, דחה (ה', 6.7.06) את עתירת התושבים הפלשיתינים מהכפר תפוח ואישר את תוואי הגדר באיזור תרקומיה. בנוסף, אישרו השופטים את מיקומו של מסוף תרקומיה שבאיזור חברון. נשיא בית המשפט העליון, אהרן ברק, שכתב את פסק הדין, קבע כי תוואי הגדר ומיקום המסוף הכרחיים לצורך הגנה על ביטחון על אזרחי ישראל ואינם פוגעים פגיעה שאינה מידתית בתושבי האיזור הפלשתינים.
את העתירה, הגישו שלושה מתושבי הכפר תפוח שעל שטחם יוקם המסוף החדש. בעתירה, שהוגשה על-ידי עוה"ד אייל ויטנברג ושגיא ויינשטיין, טענו התושבים, כי הפגיעה בהם כתוצאה מבניית המסוף וגדר ההפרדה אינה מידתית. העותרים, דרשו למצוא חלופה הפוגעת באופן מצומצם יותר באדמתם, וזאת על-ידי הסטת מיקום המסוף החדש כ- 500 מטר מערבה.
נציג המדינה, עו"ד יובל רויטמן, טען מנגד, כי בניית המסוף הינה מידתית, כאשר במסגרת עבודת המטה לבחירת מיקום המסוף החדש, נלקחו בחשבון, בין היתר, השיקולים הבאים: התאמת השטח המיועד חיבור המסוף למערכת כבישים ראשית וקיימת, חיבור המסוף החדש לתוואי גדר הביטחון באותו אזור; ביטחון והגנה מרחבית על המסוף מידת הפגיעה באדמות פרטיות; וכן, מידת הפגיעה בחופש התנועה. השטח שנבחר מחייב אומנם תפיסת אדמות פרטיות, אךהתפיסה הינה מידתית ביחס לצרכים הביטחוניים.
השופט ברק, שכתב את פסק הדין, ציין בדומה לעתירות אחרות שהוגשו בעניין תוואי הגדר, כי ההלכה המחייבת היא זו שנקבע בפרשת "אלפי מנשה" ולפיה "מוסמך המפקד הצבאי להורות על הקמת גדר הפרדה באזור יהודה ושומרון, אם ביסודה מונח שיקול ביטחוני-צבאי. עד כמה שהקמת הגדר היא צורך ביטחוני-צבאי, אין בעצם הפגיעה בקניין הפרטי כדי לשלול את הסמכות להקימה".
באשר לעתירה זו, קבע ברק, כי "מתוך הנתונים שהובאו בפנינו עולה כי מסוף תרקומיה החדש, וכן תוואי גדר הביטחון הסמוך לו, מוקמים מטעמים צבאיים ביטחוניים, כחלק מן המאבק במתקפת הטרור על ישראל מאז חודש ספטמבר 2000. בראשם של טעמים אלה, עומד הצורך למנוע חדירת גורמים חבלניים מאזור יהודה ושומרון לשטח ישראל, וזאת בשטח המשמש לתנועה רבה של שוהים בלתי חוקיים מן האזור לישראל. נמצא כי המפקד הצבאי מוסמך לפעול להקמת המסוף החדש, ואף מוסמך הוא לקבוע גדר הפרדה באזור הסמוך לו".
השופט ברק, מציין עוד בפסק הדין, כי "הקמת מסוף תרקומיה החדש, כחלק ממכלול הפעולות להקמת גדר הביטחון, נובעת מצורך ביטחוני חיוני, שהרי מטרת הגדר הינה להגן על חייהם של אזרחי ישראל מפני פעולות טרור".
היות שכך, החליטו השופטים לדחות את העתירות ולקבוע כי תוואי הגדר ומיקום המסוף בתרקומיה יישארו על מכונם.
