לאחר המהומה הגדולה בתום תפילות הר הבית, נרגעו הרוחות (שישי, 9.2.07). עשרות המתפללים שהתבצרו במסגד אל-אקצה החלו בפינוי המקום. פינוי המסגד התאפשר בעקבות שיחה בין חבר הכנסת טאלב א-סנע ופיקוד משטרת מחוז ירושלים, שבה הוחלט כי מאות הצעירים יעזבו את שטח ההר ללא ידויי אבנים. בעת ההתפרעויות שהו בהר הבית כ-3000 מתפללים.
מפכ"ל המשטרה, משה קראדי, מסר בתדרוך שערך בצהריים לעיתונאים כי האירוע טרם הסתיים, אולם כעת רגוע. לדבריו, כמאה איש עדיין נמצאים על ההר ומתנהל מו"מ לשחרורם מבלי שייעצרו. "בשעה זו", אמר קראדי, "אין הפרות סדר; הכל שקט". המפכ"ל הוסיף כי הוא היקצה שוטרים לעצרת בנצרת לשמור שזו תתנהל כסידרה נוכח האירועים בהר הבית.
שוטרים רבים פרצו להר הבית, לאחר שמכיוון ההר נזרקו אבנים. רחבת הכותל פונתה מן המתפללים מחשש ליידויי אבנים. מאות התבצרו באל-אקצה. המשטרה הגיבה בירי רימוני הלם. גם מחוץ להר הבית נרשמו התפרעויות ליד המחסומים, זאת לאחר שהדרשן נשא נאום הסתה. אחר-הצהריים השתרר שקט במקום. משטרת ירושלים מסרה הודעה כי "הר הבית תחת שליטה".
שוטרים נפצעו בהתפרעויות
15 שוטרים נפצעו באורח קל מאוד. מד"א טיפל בפצועים במקום. כמו כן נפצעו שלושה מתפללים מוסלמים שלא מצאו מחסה מן האבנים. בראש הכוחות הפורצים עמד ניצב אילן פרנקו. מפכ"ל המשטרה שהה ברחבת הכותל המערבי. הכוחות הפורצים להר לבושים חבשו אפודי מגן ועל ראשיהם קסדות. הם כיתרו את הצעירים המיידים אבנים מכיפת הסלע. הצעירים לא הסתננו להר אלא שהו שם עוד קודם להצבת מחסומי המשטרה, והכינו מראש מצבורי אבנים.
ח"כ טלב א סאנע מסר כי צוות רופאים נכנס לפנות פצועים. עוד אמר כי התנהל מו"מ לפתיחת השערים באופן שיאפשר את פינוי הפצועים, ומו"מ להפסקת הירי והרגעת הרוחות.
קודם לכן הוכרזה כוננות שיא בהר הבית. המשטרה נערכה בכוחות מתוגברים כדי למנוע הפרות סדר בתפילות יום השישי במסגדים. כ-3,000 שוטרים נפרסו בירושלים ובעיר העתיקה. המשטרה הגבילה את גיל המתפללים בהר הבית ואיפשרה כניסה אך ורק לגברים מגיל 45 שיציגו תעודות זהות כחולות. הכניסה לנשים הותרה בכל גיל.
במזרח ירושלים נרשמו הפרות סדר בודדות. החמורה שבהן הייתה כאשר כחמישים צעירים ערבים השליכו אבנים ובקבוקים אל כוח משטרה. שוטר שנפגע בידו טופל במקום. ההתפרעות פוזרה וחמישה נעצרו. ברחוב סולטן סולימן השליכו מתפרעים אבנים ונמלטו. בשער האריות ניסה צעיר שכניסתו הוגבלה לפרוץ בכוח מחסום משטרה.
החשש: התנועה האיסלאמית תגרום למהומות בצפון הארץ
העבודות בשער המוגרבים הופסקו ביום שישי בשל הרגישות הביטחונית. ראש הפלג הצפוני של התנועה האיסלאמית, השייח' ראאד סלאח, לא הורשה להגיע לעיר העתיקה. נוכחותו במקום הוגבלה על-ידי בית המשפט למרחק של 150 מטרים מחומות העיר העתיקה, לאחר שהתפרע יום קודם לכן. החשש במשטרה שהתנועה האיסלאמית, ובראשה סאלח, ינצלו את המצב הרגיש השורר בעיר העתיקה וינסו לעורר מהומות והפרות סדר בכפרי וערי המשולש בוואדי ערה והכפרים והישובים במגזר הערבי בצפון המדינה.
מפכ"ל המשטרה, משה קראדי, עקב מקרוב אחר היערכות כוחות המשטרה הפרוסים באיזור. בשעות הצהריים קיים המפכ"ל דיון הערכת מצב. למשטרה, ככל הידוע, לא הגיעו ידיעות מודיעיניות או התרעות המצביעות על כוונה להפר את הסדר במקום. החשש העיקרי היה מהתגודדויות אל מול המחסומים שהציבה המשטרה בכניסות להר הבית, ויצירת זירות התגוששות במקום בין הערבים לשוטרי מג"ב.
במשטרה לא לקחו סיכונים מיותרים. כבר ביום חמישי הורה קראדי להעלות את רמת הכוננות בכל מחוזות המשטרה בארץ לרמת כוננות ג', אחת לפני מצב חירום. מחוזות המשטרה תוגברו בכוחות למהלך כל סוף השבוע, כדי למנוע הפרות סדר, מעשי אלימות, אירועים פליליים ועוד הקשורים בצורה זו או אחרת למתח השורר בימים האחרונים בקרב הערבים - בעקבות עבודות השיפוצים במעלה המוגרבים, למרגלות הר הבית.
המפכ"ל הינה במקביל גם את יחידות אגף התנועה, שהחלו לתגבר את כוחותיהם, ואשר מגבירים את רמת הכוננות בסיורים בכבישי הארץ, כחלק מן הכוננות שהוכרזה במשטרה, שכפי המסתמן תהא לפחות עד יום ראשון.
מדינות ערב קוראות לכינוס מועצת הביטחון
מדינות ערביות החברות באו"ם דורשות ממועצת הביטחון להתערב מייד כדי לעצור את החפירות ולהבטיח שישראל תכבד את החוק הבינלאומי. בהודעה שפרסמו הן כינו את העבודות "צעד תוקפני כלפי קודשי האיסלאם שנועד להרוס דרך היסטורית". בנצרת התקיימה (ו') בשעה 15:00 עצרת מחאה נגד העבודות בשער המוגרבים. ביום שבת תדון בנושא ועדת המעקב העליונה של ערביי ישראל. נוכח זאת הורה מפכ"ל המשטרה לראש אג"ם, ניצב ברטי אוחיון, להזרים מאות שוטרים למחוז הצפוני מחשש להפרות הסדר.
הארכיאולוג מאיר בן דב, שניהל בעבר את החפירות באזור הר הבית, אמר כי העבודות במעלה המוגרבים אינן חוקיות ולא קיבלו את האישורים המתאימים. במשדר "הבוקר הזה" ברשת ב' אמר בן דב, כי אין שום צורך בעבודות ההצלה שנעשות סמוך לשער המוגרבים וכי איש אינו זקוק לגשר המתוכנן במקום. הוא הוסיף כי התריע בעבר על הסכנות הטמונות בעניין, אך דבר לא נעשה.