עם ההתרחבות המואצת של אוניברסיטת בר-אילן, יתמנה מנכ"ל האוניברסיטה, ד"ר שבתאי לובל, למשנה-לנשיא לתכנון ופיתוח. על כך הוחלט במושב חבר הנאמנים של האוניברסיטה.
בתפקידו כמשנה לנשיא לתכנון ולפיתוח, יסייע ד"ר שבתאי לובל לנשיא האוניברסיטה, פרופ' משה קוה, בעיצוב מדיניות האוניברסיטה ויעדיה העיקריים בתחום המינהלי, האקדמי, המחקרי ובטכנולוגיות מתקדמות.
ד"ר לובל, בכהונתו כמנכ"ל האוניברסיטה זה 16 שנים, שימש גם בתפקיד יו"ר פורום המנכ"לים של המוסדות להשכלה גבוהה בארץ. ד"ר לובל הוביל את המאמץ התכנוני והביצועי הקשור בקמפוס החדש שלה (צפון מזרח), באיחודו עם הקמפוס הישן (דרום מערב). כמו-גם, הוביל את האוניברסיטה להרחבת תשתיות ובינוי בהיקף שהעמיד אותה כאחת האוניברסיטאות מהירות-ההתפתחות בארץ. כתוצאה מכך, הוכפל שטחה של אוניברסיטה העומד כיום על 540 דונם עליו הוקמו מבנים בהיקף של 163,000 מ"ר.
מספר הסטודנטים, הינו כ-32,000 (כולל את המכללות המסונפות). גולת הכותרת של פעילותו בשנים האחרונות היתה בשמירה על האיזון התקציבי בה, ללא הקטנת נפח הפעילות, אף בעת המשבר הגדול של האוניברסיטאות בחומש האחרון עת קוצצו למעלה מ-20% מבסיס תקציביהן.
בשש עשרה שנות כהונתו כמנכ"ל צמחה אוניברסיטת בר-אילן ברמת גן ממוסד צנוע במתקניו ובנפח פעילותו, לאחת מאוניברסיטאות המחקר המובילות בעולם.
ד"ר לובל מלווה את האוניברסיטה בכל שלבי צמיחתה. הוא פעל רבות נגד הסתגרות האקדמיה במגדל השן ויזם פרויקטים לאומיים וחברתיים לרווחת כל חלקי האוכלוסיה. 30 שנה לפני העידן הנוכחי של ריבוי המכללות יזם ד"ר לובל את הקמתן של השלוחות האקדמיות של אוניברסיטת בר-אילן באזורי הפריפריה וכן כ-10 שלוחות בבסיסי צה"ל – מסיני עד רמת הגולן. כמו-כן, הגה תוכניות יחודיות למערכות הביטחון השונות.
בנוסף לפעילותו המינהלית, מקיים ד"ר לובל פעילות אקדמית כמרצה בחוג המשולב למדעי החברה, במדעי המדינה ובמסגרות אחרות.
לתפקידו החדש כמשנה לנשיא לתכנון ולפיתוח ייכנס ד"ר שבתאי לובל, לאחר שייבחר מנכ"ל חדש לאוניברסיטה.