שר הפנים מאיר שטרית העניק (יום ב', 24.12.07) כתב הכרה בפטריארך היווני אורתודוכסי תאיופיליוס, זאת לאחר שבג"צ נענה לבקשה דחופה של הממשלה להסיר את הצו המונע הכרה זו.
הצו הוצא על-ידי הפטריארך המודח הקודם, אירינאוס 1, אשר טען כי גורמים ממשלתיים היו מעורבים בהדחתו, והגיש על כך תלונה למשטרה. הממשלה טענה בבקשה לבג"צ כי מינוי הפטריארך חשוב לקראת חג המולד וזאת לצורך נוכחותו בטקסים ובאירועים נוצריים רבים.
על פניה נראית פרשת מינוי הפטריארך נושא "נוצרי" פנימי אך למעשה מדובר בפרשה העוסקת בשליטה של הכנסייה היוונית אורתודוכסית על קרקעות רבים במדינת ישראל. הפטריארך הקודם אירינאוס הודח בין היתר על-רקע חשדות נגדו בנושאי מכירת קרקעות לישראלים. הפטריארך החדש התחייב בפגישתו עם השר רפי איתן לפעול על-פי "עקרון השוויון", ולפעול בהתבסס על החלטות "הסינוד הקדוש", הגוף הבוחר את הפטריארך מטעם הכנסייה היוונית אורתודוכסית, ו"בלא התחייבות לירדן או לפלשתינים".
החשדות הנוגעים למעורבות גורמים ממשלתיים בנושאי קרקעות הכנסייה הובילו לפנייה של תנועת אומ"ץ (יום א', 23.12.07) ליועץ המשפטי מזוז בדרישה להורות למשטרה לפתוח בחקירה פלילית נגד ראש הממשלה אולמרט ושרי הממשלה בחשד לכאורה לעבירות של "זיקה פרטית, מרמה והפרת אמונים".
לטענת העמותה, מפרסום לפני כחודש בידיעות אחרונות עולה כי בשעתו עוכב מינויו של תיאופולוס ג'אנופולוס, כפטריארך היווני במקומו של איריניאוס הראשון, "בשל סירובו לעסקת נדל"ן שאמורה היתה להתבצע באדמות הכנסייה בבית שמש. בעסקה זו היה מעורב עורך הדין אורי מסר, ידידו ומקורבו של ראש הממשלה".
עוד עלה מהפרסום, כי תיאופולוס נפגש בין השאר עם יועצת ראש הממשלה לשעבר רבקה פאלוך, שאמרה לו: "ראש הממשלה מוסר לך דרישת שלום ואומר שצריך לפתור את הבעיה עם אדמות הפטריארכיה בבית שמש". העמותה טוענת כי מהפרסום עולה חשד כי מינוי הפטריארך עוכב על-רקע קשיים בהשלמת עסקת בית שמש, וכי במהלך שיחותיה של גברת פאלוך עם תיאופולוס, התברר לו שהיה קשר ישיר לכאורה בין לשכתה לבין משרדו של עורך הדין מסר.
עוד נטען על-ידי העמותה, כי בפרסום טען תיאופולוס שנודע לו כי מי שיזם את הפגישה מאחורי הקלעים, ונפגש עם מזכיר הכנסייה, הארכיבישוף אריסטרכוס, ללא ידיעתו היה עורך הדין מסר. "את השם הזה שמעתי לא אחת, וזמן קצר אחר כך, כשאולמרט נבחר לראש הממשלה, אמרו לי כמה וכמה אנשים שכדאי לי להיפגש איתו, כי הוא מקושר לראש הממשלה, ושאם אפגוש אותו הכל יהיה בסדר".
תמיהה נוספת אותה מעלה התנועה, היא אופן מינויו של הפטריארך החדש. התנועה מציינת את פגישתה ביולי 2006 של ועדת השרים לענייני הפטריארך בראשות השר רוני בר און עם המועמד לפטריארך החדש, תיאופולוס. לאחר הפגישה החליטה הוועדה שלא לקדם את המינוי והנה "רק לפני כמה חודשים, לאחר שבראון התפטר מראשות הוועדה, ובמקומו מונה השר רפי איתן, קודם המינוי ובימים אלה אישרה הממשלה את המינוי".
התנועה דורשת מממזוז לחקור את פרשת מינוי הפטריארך.
כאמור, בטקס שנערך (יום ב', 24.12.07) בלשכתו של שר הפנים שטרית הוענק כתב הכרה לפטריארך היווני אורתודוקסי תיאופילוס.