חבר הכנסת אופיר פינס (עבודה) מוחה על העובדה שבמפת העדיפות הלאומית מופיעים ארבעה יישובים בלתי חוקיים: "המאחז הבלתי חוקי שבות רחל, סנסנה שקמה ללא החלטת ממשלה וללא תוכנית בתוקף, גבעות שאיננו יישוב מוכר וברוש שהוא בכלל כפר נופש פרטי".

ח"כ פינס קרא לשרי העבודה לקבוע את תעדוף ההתנחלויות המבודדות כקו אדום להישארותם בממשלה: "קשה לי להאמין שברק מודר מהנושא ולא היה שותף ביצירת המפה, כשידוע ששרים וח"כים היו מעורבים בהתייעצויות שעיצבו אותה. ההחלטה על ההקפאה הייתה רימון עשן לצרכי הטעיה והסחת תשומת הלב הציבורית ממפת העדיפויות הלאומיות המתעדפת את ההתנחלויות".

גם יו"ר האופוזיציה, ציפי לבני, מתחה ביקורת נוקבת על מפת סדרי העדיפות הלאומית החדשה: "זהו סדר עדיפות פוליטי ולא תקציבי, שאין בינו ובין סדר עדיפות לאומי דבר. סדר עדיפות לאומי זה הנגב והגליל ושמירה על גושי ההתיישבות הגדולים. כשקורצים לשני הכיוונים זה יוצר עיוורון פוליטי", אמרה לבני.

לבני מתחה ביקורת על הנזק שמסיבות ההתנחלויות למדינה "אין לי ספק בזכות התנ"כית שלנו על חלקי ארץ ישראל כולה אך המטרה שלנו זה קיום כמדינה יהודית ודמוקרטית, אך כדי ששני הדברים האלה לא יתנגשו צריך רוב יהודי. הכרעה נדרשת כי לא ניתן להגיע להסדר על הדרך, ואם לא נגיע לכזה, המחיר שנשלם יהיה גבוה יותר מהמחיר הקשה ממילא שנשלם עבור הסדר", אמרה.