בית המשפט העליון קיבל חלקית ערר שהגישה המדינה בנוגע למעצר הבית שהוטל על ענת קם, והחליט להחמיר את תנאי המעצר שהוטלו עליה. בית המשפט העליון קבע כי ענת קם תהא כפופה למעצר בית מלא במשך 24 שעות, וכי מעתה והלאה גם תהיה כפופה משך 24 שעות ביממה לפיקוח של אחד מהוריה או אחותה או דודתה.
כמו-כן הורה בית המשפט העליון כי יהיה עליה להתייצב בתחנת משטרה פעם בשבוע, כאשר היא מלווה על-ידי אחד מהמפקחים שנקבעו. במקביל, בית המשפט דחה לחלוטין את הערר שהגישה קם נגד מעצרה ותנאיו.
בהחלטתה קבעה השופטת
אילה פרוקצ'יה כי המעשים המיוחסים לקם - כלשון ההחלטה - "נושאים חומרה מיוחדת במספר רבדים: בראש ובראשונה הם עשויים לפגוע פגיעה של ממש באינטרסים חיוניים של המדינה בהיבטים ביטחוניים וצבאיים. שנית, הם מערערים נורמות פליליות בסיסיות הקשורות בחובות סודיות החלות על כל אדם המועסק במערכת השירות הציבורי, ובמיוחד על מי שמשרת במערכות הביטחון, שבהן לחובות אלה מעמד ומשמעות מיוחדים; ושלישית, יש במעשים המיוחסים לענת קם משום הפרה מהותית של נורמות המשמעת בצבא, ופגיעה עמוקה באמון הבסיסי המתחייב ביחסי מפקדים ופקודים, שבלעדיו רמת תפקודה של המערכת הצבאית והביטחונית תיפגע פגיעה קשה".
כן קבע בית המשפט העליון כי "המעשים המיוחסים לענת קם מצביעים, לכאורה, על עיוות פנימי עמוק בתפישת חובותיו של חייל כלפי המערכת הצבאית אותה הוא נדרש לשרת, וסטייה חמורה מאחריות בסיסית שאזרח חב כלפי המדינה אליה הוא משתייך". בית המשפט קבע כי המעשים המיוחסים לקם מהווים הפרה של נורמות פליליות "מהחמורות ביותר". עוד נקבע כי "עשיית דין עצמית במידע מסווג וסודי ביותר הנוגע למערכת הביטחונית, טומנת בחובה סכנה פנימית עמוקה. הותרת ההחלטה בידי חייל או אזרח מן השורה מה ייעשה במידע סודי של רשות שלטונית, ובמיוחד של רשות ביטחונית, עלולה לסכן אינטרסים חיוניים של המדינה ולערער מן היסוד את מבנה המערכות".
בית המשפט העליון הדגיש כי "טעם של "תיקון עולם", ככל שהוא עולה מפיו של הפרט, אינו יכול לשמש הסבר או תשובה לעשיית דין עצמית כאמור", וכן ציין כי העונש הצפוי בגין מעשים אלה עשוי להיות "חמור וממשי". עוד נקבע כי יש חשש שיעשה גם בעתיד שימוש פסול בחומר הסודי שנלקח על-ידי קם וטרם אותר. חשש זה מתחזק מכך שלטענת ענת קם היא "חדורת מוטיביציה אידיאולוגית בפעולתה".
לעניין שאלת מעצרה של ענת קם כתב בית המשפט כי "אפשר והיה מקום בתחילת הדרך להורות על מעצרה" (מאחורי סורג ובריח). יחד עם זאת, נוכח חלוף הזמן הניכר שבמהלכו שהתה קם במעצר בית, ומכיוון שלא ידוע על כך שהיא הפרה את תנאי שחרורה, החליט בית המשפט העליון להסתפק בהחמרת תנאי מעצר הבית. לצד זאת, הבהיר בית המשפט העליון כי כל סטייה מהחובות והתנאים שהוטלו על קם עלולה להביא למעצרה הממשי וכן קבע כי "הקו המפריד בין מעצר ממש לחלופת מעצר הוא דק מן הדק בנסיבות מקרה זה".
פרקליטיה של קם יבקשו דיון נוסף בתנאי מעצרה.