הגורמים הממשלתיים לא יישמו את רוב החלטות הממשלה בנוגע לשינוי המבני במשק החשמל, וחברת החשמל היא עדיין מונופול מלא בתחום - כך קובע (יום ג', 11.5.10) מבקר המדינה בדוח הביקורת שלו לשנת 2009.
ראו: הנוסח המלא של הדוח בחודשים פברואר 2009 עד אוגוסט 2009 בדק משרד מבקר המדינה את הפעולות לביצוע השינוי המבני במשק החשמל. הבדיקה נעשתה במשרד התשתיות, במשרד האוצר, ברשות החברות, ברשות החשמל ובחברת החשמל עצמה.
במועד סיום הביקורת נמצא כי שתי חברות ממשלתיות שבבעלות המדינה - חברת ניהול המערכת וחברת תחנות ייצור - שהוקמו באוקטובר 2008 על-פי החלטת ממשלה מיוני אותה שנה, טרם החלו לפעול, ופעילות ניהול המערכת עדיין מבוצעת בידי חברת החשמל.
הבדיקה העלתה כי הגורמים הממשלתיים טרם מצאו דרך שתאפשר להעביר מחברת החשמל לחברת ניהול המערכת את הנכסים הנדרשים לשם ניהול מערכת החשמל או דרך שתאפשר להקימם מחדש.
בנוסף, טרם נקבע הסדר לחלוקת נכסי חברת החשמל - ששוויים הכולל הוא כ-74 מיליארד שקל - בין החברות שיוקמו, ולא נקבעו כללים לאופן חלוקת נכסים שישמשו יותר מחברה אחת. בעיה נוספת העומדת על הפרק, היא שהגורמים הממשלתיים טרם קבעו הסדר לטיפול בהתחייבויות חברת החשמל, המסתכמות בכ-57.5 מיליארד שקל, לאחר ביצוע השינוי המבני.
מבקר המדינה מצא כי הגורמים הממשלתיים כלל לא הכינו אומדן של עלות ביצועו של השינוי המבני הכוללת, בין היתר, פיצויי פרישה והטבות בסכומים גדולים לעובדים, כגון מענקים ותוספות שכר. נמצא כי לא נקבעו המקורות הכספיים למימון השינוי המבני, חוץ מאשר בשני נושאים - נושא התשלומים לעובדים (אשר ימומן באמצעות תעריף החשמל) ונושא הקמת חברת ניהול המערכת וחברת תחנות הייצור (שהקמתן תמומן באמצעות תעריף החשמל ומקורות מימון אחרים אשר "ייקבעו, ככל הנדרש, על-ידי גורמי המדינה הרלוונטיים").
המבקר מסכם את בעייתיות הטיפול בנושא באומרו כי "מן הראוי שמשרד התשתיות, משרד האוצר, רשות החברות ורשות החשמל ינתחו את הסיבות לחוסר ההצלחה לבצע את השינוי המבני במשק החשמל, יפיקו לקחים ויגבשו תוכנית שינוי מבני מתוקנת ולוח זמנים לביצועה, שתאפשר להוציא לפועל את הרפורמה".
המבקר מציין כי הוצאת השינוי המבני במשק החשמל מן הכוח אל הפועל חשובה למשק בישראל במטרה לפתח בו תחרות ולייעל אותו, לשתף גורמים מהמגזר הפרטי שיגדילו את כושר הייצור במשק ויתרמו לגיוון מקורות האנרגיה וכדי שמשק החשמל לא יתבסס רק על חברת החשמל כיצרנית העיקרית במשק.