החברה המעניקה את החתימה האלקטרונית למשתמשי מערכת "נט המשפט" של הנהלת בתי המשפט, נקנסה בידי משרד המשפטים בשל הפרות של חוק תחימה אלקטרונית. חברת קומסיין שילמה 143,200 שקל לאחר שבחרה שלא לערער לבית המשפט על החלטת רשם גורמים מאשרים ברשות למשפט, טכנולוגיה ומידע (רמו"ט), עו"ד עמית אשכנזי.
חוק חתימה אלקטרונית מקיים משטר רישום ופיקוח על פעילות הנפקת תעודות אלקטרוניות לחתימה אלקטרונית על-ידי "הגורם המאשר" - הגורם המנפיק את התעודות האלקטרוניות (במקרה זה: קומסיין). מטרת החוק היא ליצור ודאות לגבי הזהות הדיגיטלית שקבועה בתעודה, והוא מבוסס על טכנולוגיות וכללי פעולה מקובלים בעולם בתחום ההצפנה הנקרא תשתית המפתח הציבורי.
בשנת 2009 קבע רשם גורמים מאשרים מגבלות על הנפקתן של תעודות אלקטרוניות על גבי רכיבי חומרה המשמשים כשרתי חתימה אלקטרונית. ההנחיה אסרה להנפיק תעודות אלקטרוניות על גבי חומרת הצפנה הנמצאת בשירותן של חברות גדולות מבלי להסדיר נושא זה באופן מסודר מול הרשם, וזאת במטרה לשמור על רמת אבטחת נאותה. לדברי משרד המשפטים, בשנת 2010 התנהלו עם קומסיין דיונים על-מנת לקבוע את הכללים שיחולו על פעילות זו ואופן הבאתם לידיעת הציבור באמצעות תקנון השירות המאושר של קומסיין.
בבדיקה שערכה רמו"ט השנה בקומסיין התברר, כי בניגוד להנחיית הרשם ומבלי להודיע לו, הנפיקה קומסיין תשע תעודות אלקטרוניות שלא במסגרת ההגבלות שניתנו בהנחיה, וזאת במקביל לדיונים שנוהלו מול הרשם. שתיים מהתעודות הונפקו לאחר כניסתו לתוקף של התיקון בחוק חתימה אלקטרונית, המסמיך את רשם גורמים מאשרים להשית עיצום כספי על הגורמים המאשרים בשל הפרת הוראותיו, והוא ניצל סמכות זו.
משרד המשפטים ציין, כי עצם הסמכת רשם גורמים מאשרים להטיל עיצום כספי הוכנסה ביוזמת ח"כ
מאיר שטרית בעקבות הדוחות השנתיים של רמו"ט, אשר תיארו אי-ציות מתמשך של קומסיין להנחיות הרשם, והצביעו על החוסר בסנקציה אפקטיבית. לדברי אשכנזי, "המסכת העובדתית והמשפטית מלמדת כי קומסיין בחרה לעשות דין לעצמה לעניין אופן פעולתה לפי החוק, חרף הנחייה מפורשת של הרשם. מטרת העיצום להדגיש, כי לא ניתן לעבור לסדר היום על הפרה ישירה של הנחיית הרשם".
קומסיין מסרה בתגובה, כי המחלוקת שלה עם הרשם הייתה פרוצדורלית בלבד, ולא הועלתה כל טענה בנוגע לרמת אבטחת המידע או כאילו עברה על החוק. לדברי החברה, היו לה מחלוקות רבות עם אשכנזי, אשר לטענתה מעכב שלא לצורך את התפתחות תחום החתימות האלקטרוניות. בנושא הספציפי, אומרת קומסיין, מדובר באי הבנה של הנחיית הרשם בנוגע לתעודות אלקטרוניות מסוג HSM: הרשם הורה להפסיק את השימוש בכלל, בעוד החברה סברה שמדובר על איסור להנפיק תעודות חדשות. לדבי קומסיין, היא החליטה שלא לפנות לבית משפט מכיוון שהיא מאמינה שלשם המשך התפתחות שירותי החתימה האלקטרונית, מן הראוי לסיים מחלוקות עבר ולהמשיך קדימה.
