נשיא המדינה,
שמעון פרס, פרס מסר את תנחומיו לראש הממשלה ולמשפחתו על מותו של פרופסור בן ציון נתניהו ואמר כי היה "היסטוריון גדול ויהודי גדול". לבקשתו של פרס כיבדו הנוכחים בטקס הנחת אבן הפינה לבית הספר הטכני של חיל האוויר בכרמיאל את זכרו של נתניהו בדקת דומייה.
נשיא המדינה צפוי להשתתף בהלווייתו של פרופ' נתניהו שתערך היום בשעה חמש בירושלים. על-מנת שיוכל לעשות זאת ביטל הנשיא פרס את המשך ביקורו הממלכתי בעכו שתוכנן להיום אחר-הצהריים.
יושב-ראש הכנסת, ראובן ריבלין, ספד לפרופסור בנציון נתניהו שהלך הלילה לעולמו ואמר כי היה אחד הציונים הגדולים ואחד הרוויזיוניסטים האחרונים שנשארו.
"הכרתי אותו דרך משפחתו וגם כאדם שקשר את חייו לירושלים והוא היה אחד מגדולי החוקרים, אחד מהציונים הגדולים ואחד מהרביזיוניסטים שנשארו", אמר.
לדברי ריבלין, בנו של בנציון למד כי אין להתפשר יותר מדי מהר. "
בנימין נתניהו חונך בבית שלימדו בו הרצל, אם כי הריאל פוליטיק אצל ביבי הרבה יותר מפותח", אמר.
שר החינוך,
גדעון סער, אמר כי פרופ' נתניהו היה חוקר חשוב, מעמיק ומקורי. מחקרו הגדול והמהפכני על אודות תקופת האנוסים והאינקוויזיציה הוא בעל ערך היסטורי חשוב.
"פרופ' נתניהו ניחן לצד תפיסתו הציונית המובהקת גם בראייה מפוקחת של הסכנות והאיומים הנשקפים לעמנו. הוא גידל שלושה בנים, שהיו כולם לוחמים בשדה הקרב והנחיל להם את המחויבות העמוקה להקרבה לעמם ולמדינתם", אמר.
ח"כ
אופיר אקוניס (הליכוד) אמר כי הוא משתתף בצערו של ראש הממשלה נתניהו ובצער המשפחה כולה על מותו של פרופ' בן ציון נתניהו ז"ל. "פרופ' נתניהו היה אחד מאנשי הרוח הגדולים של האקדמיה והתרבות הציונית והיהודית. שקראתי את ספרו "חמש אבות הציונות", הרגשתי שמי שכתב אותו ליווה, אישית, את הסיפור הציוני, כמעט מתחילתו ובמשך 102 שנים", אמר.
ח"כ
יואל חסון (קדימה) אמר כי בנציון נתניהו היה ציוני בכל רמח אבריו, פטריוט בנשמתו ואוהב ארץ ישראל. "מדינת ישראל נפרדת הבוקר מאחד ממנהיגי התנועה הציונית, אדם מיוחד שהקדיש את מרבית חייו למען המפעל הציוני ועמל רבות על מחקרים הנוגעים להיסטוריה של העם היהודי ובעיקר בכל הנוגע ליהדות ספרד, שמחקריו הרבים והחשובים התמקדו בה.אני משתתף בצער משפחת נתניהו, ושולח את תנחומי לראש הממשלה ומשפחתו", אמר.
גם מועצת יש"ע פרסמה הודעת תנחומים על מותו של פרופ' נתניהו. "פרופ' בן ציון נתניהו, איש ארץ ישראל השלימה, ציוני של ציון, אשר היה מקור השראה לרבים בנאמנותו לדרך הציונות הלאומית", לשון ההודעה.
