לשכת המבקרים הפנימיים ישראל תאפשר למבקרים פנימיים לקבל תעודת "מבקר פנימי מוסמך" ותעודת "מבקר פנימי מומחה", בהן יזכה מי שיעמוד באמות המידה ובכללי המקצוע והדין של הביקורת הפנימית בישראל ובאמות מידה מקצועיות בינלאומיות שיש להן תוקף בארץ, אותן אישרה המועצה העליונה לקידום רישוי חקיקה והסמכה של לשכת המבקרים הפנימיים ישראל.
שיטת הסמכה מקצועית זו, שהינה ייחודית למדינה, כבר עוררה עניין גם בחו"ל ואנשי ביקורת במדינות המערב כבר פנו וביקשו מידע מפורט עליה.
ההסמכה למבקרים פנימיים, שנועדה להעניק השבחה ועִדכון מתמיד של רמה מקצועית גבוהה בביקורת, ניתנת בנוסף לגיבוש ויישום מערך לימודים לתואר שני ולימודי תעודה בביקורת פנימית שאושרו על-ידי ועדת ההשתלמויות על-פי חוק הביקורת הפנימית תשנ"ב -1992.
הביקורת הפנימית מהווה מקצוע רב תחומי ודינמי המחייב תואר אקדמי יחד עם התמחות והשתלמות נרחבות ומתמידות בהתאם לשינויים שחלים בסביבה העסקית והמשפטית של האִרגונים השונים. כידוע, מזה שנים רבות מקבלים רישיון לעסוק במקצועם בעלי מקצוע חופשיים כגון עורכי דין, רואי חשבון, מורים, רופאים ועוד, לאחר שנבחנו ועמדו בדרישות שנועדו להבטיח שהם בעלי הכשרה וניסיון נדרשים המעוגנים בחוק. עתה מצטרפים אליהם גם המבקרים הפנימיים.
הגוף האחראי על תהליכי ההסמכה, בסיס הידע הנדרש ותוכן הבחינות הוא מועצת ההסמכה של לשכת המבקרים הפנימיים - גוף אוטונומי ועצמאי שאינו כפוף להנחיות או החלטות הנהלת הלשכה ולא של כל מוסד אחר ממוסדותיה.
