חיילי צה"ל לא יוכלו להמשיך ולנסוע חינם בקווים החדשים של רכבת ישראל. מדובר בשני קווים חדשים שהחלו לפעול ב-13.9.03: קו ת"א - בית שמש וקו ת"א - ראשון לציון. בשאר קווי רכבת ישראל תמשיך כרגיל נסיעת חיילים בחינם.
רכבת ישראל הודיעה, כי היא פועלת כדי להרחיב את ההסכם הקיים עם משרד הביטחון גם לקווים החדשים, אך עד כה לא צלחו המגעים. בתחילה נקבע תאריך סיום ל-26 באוקטובר, הוא נידחה עד ל-1 בנובמבר, ובעקבות החלטת משרד הביטחון הוחלט, כי החל מיום ד' הקרוב, 5 בנובמבר 2003, ייאלץ חייל שיבקש לנסוע בקווים החדשים - לממן את הנסיעה מכיסו.
משרד הבטחון מממן את הנסיעה לחיילים בכל קווי הרכבת הקיימים, ומעביר מדי שנה לרכבת סכום הנאמד בכ-100 מיליון שקלים. החייל מציג את פנקס החוגר בפני מערכת קריאה אלקטרונית, המנפיקה לו כרטיס נסיעה בקווי הנסיעה שבהסדר.
הנחת העבודה קובעת, כי הנסיעה ברכבת מהירה ובטוחה מהנסיעה בשאר כלי התחבורה היבשתית.