גופותיהם של הנערים החטופים נפתלי פרנקל, גיל-עד שאער ואייל יפרח נמצאו (יום ב', 30.6.14) באזור חלחול שמצפון לחברון. הגופות התגלו בסמוך לשעה 17:00 בידי כוחות של כפיר ומגלן. ההערכה היא, כי השלושה נרצחו בסמוך מאוד לחטיפתם ב-12.6.14.
ההערכות הן, כי החוטפים- אנשי הזרוע הצבאית של חמאס - תכננו מראש לרצוח את החטופים ולשאת ולתת על החזרת הגופות. נראה שהמצוד הנרחב אחרי החוטפים הביא אותם לזנוח תוכנית זו ולהותיר את הגופות בשדה הפתוח בו נתגלו, כאשר הן מוסוות בצורה חלקית בלבד.
הגופות הוטמנו בבור לא עמוק שנחפר על-ידי חוטפיהם בוואדי שבין הכפר בית כחיל לחלחול, סמוך לבריכה חקלאית. המחבלים כיסו את מקום הקבורה בשיחים, ביריעת פלסטיק ובאבנים. לפני כמה ימים נמצאו בסמוך משקפיים וסנדל של אחד החטופים, ואלו מיקדו את המחפשים בשטח זה.
דרגי הפיקוד הבכיר בפיקוד המרכז ורבנים צבאיים הגיעו ראשונים למקום, ובהמשך הגיעו למקום הרמטכ"ל ואלוף פיקוד המרכז. הודעות נמסרו למשפחות החטופים, והן מכונסות בבתיהן עם קצינות נפגעים וצוותי ביטחון המלווים אותן מיום החטיפה. החשש לחייהם של הנערים הלך וגבר ככל שחלף הזמן מאז החטיפה בלא שארגון כלשהו קיבל עליו את האחריות למעשה ובלא שהוצבו דרישות כלשהן להשבתם של החטופים.
הקבינט המדינה-ביטחוני התכנס בשעה 21:00 כדי לקבל עידכונים והחלטות על התגובה הישראלית לרצח הנערים. השר
אורי אריאל וסגן השר
דני דנון כבר קראו להמשיך ואף להגביר את הפעילות נגד חמאס, המבוצעת מאז החטיפה. מקורות בחמאס הביעו מוקדם יותר חשש מפני התגובה הישראלית הצפויה. לאחר כארבע שעות הופסק הדיון והוא יימשך היום.