מנכ"ל רשות הנמלים והרכבות צריך להפעיל שיקול דעת עצמאי בבחירת מנהל כללי לרכבת ישראל. כך קובע בג"צ בהרכב של השופטים אהרן ברק, אליעזר ריבלין ואילה פרוקצ'יה.
פסק הדין ניתן בעתירה שהגישה התנועה לאיכות השלטון, אליה הצטרף מנכ"ל הרכבת היוצא, עמוס עוזני. העתירה הוגשה נגד שר התחבורה, אפרים סנה, ונגד מנכ"ל רשות הנמלים והרכבות, גדעון שמיר.
עוזני והתנועה לאיכות השלטון טענו במסגרת העתירה, כי החלטת השר סנה, שלא לאפשר לעוזני לכהן תקופה נוספת כמנכ"ל הרכבת - מבלי להותיר שיקול דעת בידי מנכ"ל רשות הנמלים והרכבות שהוסמך לכך בחוק - נגועה בשיקולים פוליטיים.
עוזני טען, כי השר סנה ביקש שלא לחדש חוזה העסקתו כמנכ"ל הרכבת, למרות שהציג תוצאות עסקיות מצויינות ב-5 שנות כהונתו. על-פי עוזני, גדלו הכנסות הרכבת בעת כהונתו פי-5. הוא טען, כי סנה פעל משיקולים פוליטיים, כדי להחליפו בפעיל מפלגת העבודה ומקורבו, יוסי שניר.
במסגרת העתירה הובהר, כי השר סנה הודיע למנכ"ל הרשות על החלטתו שלא למנות שוב את עוזני, עוד בטרם נבדקה אפשרות של המשך תיפקודו כמנכ"ל הרכבת. מנגד הציג השר בבית המשפט, לשם ביסוס חוסר התאמתו של עוזני, את מה שהגדיר: "סגנונו הבוטה והארוגנטי ותלונות רבות שקיבל על תפקודו".
בהחלטתו קבע בית המשפט, כי יש טעם לפגם בהחלטת שמיר, שלא לקיים בדיקה לגבי כדאיות חידוש החוזה עם עוזני. על-פי בג"צ: "פגם זה אינו בהעדפת שנתן לשניר, אלה בכך שלא שקל באופן עצמאי את מועמדותו של עוזני ולא הישווה בנו לבין שניר". על-פי בג"צ, המליץ שמיר על שניר, "תוך שהעניק לעמדת השר משקל מכריע בשיקוליו", וזאת לאחר שהבין והודרך כי זה רצונו של השר סנה.
השופטים קובעים בפסק הדין, כי שמיר "ביטל שיקול דעתו כנגד שיקולי השר, שלל את עצמאות שיקול דעתו ובכך שיבש את התהליך המשולש שקבע החוק למינוי". בג"צ קובע עוד, כי על מנכ"ל הרשות (שמיר), לשקול את מחדש את המלצתו למינוי מנהל לרכבת ולעשות זאת "בלב פתוח".
בג"צ קובע במקביל, כי עוזני, לא הצליח להוכיח שהשר סנה פעל ממניעים פוליטיים בעת שביקש לקדם את בחירתו של שניר. בית המשפט מגלגל בכך את הכדור בחזרה לפיתחו של מנכ"ל הרשות, שמיר, וקובע כי על המנכ"ל לבדוק את טענות עוזני ואת תשובות השר לגבי הרקע להמלצות.
התנועה לאיכות השלטון בירכה על פסק הדין. נמסר, כי ישנו מסר חשוב ומעודד בהחלטת בית המשפט לעובדי ציבור המקשים להאריך כהונתם. התנועה רואה בהחלטת בג"צ תכתיב לביצוע החלטות בתחום זה, שיהיו חפות מתכתיבים ונשענות על שיקול דעת עצמאי וענייני.