במהלך הדיון נרשמו חילוקי דעות רבים בין נציגי ארגוני ההצלה וחברי הכנסת בנוגע לחוק. נציגי מד"א ומשרד הבריאות לא היו מעוניינים בנוסח החוק המחייב פיקוח ישיר של המשרד על מנהל המוקד, וכן לגבי נציג של ארגון עזר רפואי אחר במוקד. קטיה קיל, מנהלת תחום פיקוח במשרד הבריאות, אמרה שלא נכון להיכנס לבעיה בין הארגונים: "המטרה של כולנו היא הצלת חיים - הושבת אחד הארגונים בתוך המוקד של מד"א לא תתרום לזה. המשרד סבור שלא נכון להכניס אותם למוקד". שי סומך, ממונה חקיקה במשרד המשפטים, אמר: "יש בעיה להכניס בחוק בפעילות משותפת ארגון פרטי - הוא לא יכול להיות בפיקוח של ארגון אחר". יו"ר הוועדה, ח"כ עידית סילמן, אמרה כי המטרה בהכנסת נציג לא נועדה לפקח על העבודה של מד"א, אלא לוודא תיאום נכון כך שלא תיפגע הזנקה להצלת חיים.

לגבי מינוי מפקח ממונה על מנהל המוקד חירום של מד"א, חזרו שוב נציגי מד"א בדיון על הטענה מדיונים קודמים, כי אין בכוח החוק לקבוע כזה דבר, שכן על מד"א - בהיותו גוף של הצלב האדום - להיות עצמאי ולא כפוף לכל פיקוח שכזה.

ח"כ משה גפני, מיוזמי הצעת החוק, אמר במהלך הדיון כי אם לא ייקבע בחוק מינוי מפקח, נחזור שוב לאותה נקודה של חוסר תיאום וכל החוק מיותר. "אנחנו חוששים לחיי אדם. המציאות שאותו מוקד שהיה צריך להעביר הודעות לכל המתנדבים, לא עשה זאת. בחקיקה נאמר שלא לוקחים זאת ממד"א אלא ההפך: הם מקבלים מעמד - אבל משרד הבריאות הוא מאסדר ויהיה מעורב בזה".

ח"כ ינון אזולאי, אף הוא מיוזמי הצעת החוק, פנה בדיון לנציגי משרד הבריאות ואמר כי הצלת חיים צריכה להיות מהירה והכי טובה לחולה: "אנחנו לא יושבים לייצר חוק כשאין צורך. כאן הצורך הגיע מהשטח בצורה ברורה שקריאות לא מגיעות. אין עד היום כל דוח ביקורת אחד איך פיקחתם על החוזר שחייב זאת כך".

על אף חילוקי הדעות בין הארגונים בנוסח החוק על הצורך להסדיר את היחס והתיאום בין הארגונים בחוק, לאחר מו"מ והתייעצויות לאורך הפסקות ישיבת הוועדה מהבוקר, הגיעו יו"ר הוועדה סילמן ושאר חברי הכנסת שהשתתפו בתיווך, הוסכם על מתווה מיוחד וחדש שיוגדר בחוק בהוראת שעה לחצי שנה - הוראת השעה היא הסכם שיתוף פעולה שכולל את חיבורם, עד יום שני, של כל כונני איחוד הצלה.

במקרה שבו לארגון העזר יהיה כונן סמוך מטעמו שהגיע לאירוע מבלי שהוזנק - ארגון העזר ידכן את מד"א על הגעת הכונן, וייערך תחקיר שיועבר למשרד הבריאות שבו יוסבר מדוע לא נקרא הכונן לזירה. בתום חצי שנה יהיה דיווח על הפעילות בוועדה וייבחן שיתוף הפעולה. ח"כ משה גפני ביקש לכלול בהסכם זה שייפסקו התביעות ההדדיות בין הארגונים במשך כל אותה חצי שנה.

סילמן סיכמה: "אני שמחה שהצלחנו, לאחר שעות דיונים ארוכים, חברי כנסת מכל סיעות הבית החברים בוועדת הבריאות - קואליציה ואופוזיציה וכן מי שניסו שנים ללא הצלחה לעשות כעת התקדמות משמעותית לשיתוף פעולה ולהבנות בין ארגון מד״א לאיחוד הצלה בעניין הפעלת הכוננים ובכך להציל חיים. אין מונופול להצלת חיים. אני חוזרת על כך בכל דיון בנושא, כי המטרה שלנו היא להציל חיים, וזו צריכה להיות המטרה של כל אחד שיושב כאן סביב השולחן - אני שמחה להציג שבמהלך הדיונים הגענו להסכמה על הוראת השעה המיוחדת שתבחן במשך חצי השנה הקרובה את הרצון והאמון ההדדי שהשגנו בוועדה בין הארגונים; החוק יתקדם הלאה לקריאה ראשונה כי משרד הבריאות חייב בשוטף לפקח ולראות שהזנקה להצלת חיים מתבצעת בצורה סדירה ורצינית. לא הגיוני שדבר כה משמעותי יישאר בחוק ללא מעקב פיקוח ותיאום שמשרד הבריאות יבצע כמאסדר".