השר לביטחון פנים, צחי הנגבי, מתריע (מוצ"ש, 24.7.04) מפני כוונות של קבוצות יהודיות קיצוניות לבצע פיגוע בהר הבית, במטרה לטרפד את התהליך המדיני. השר הנגבי אמר את הדברים בראיון לתוכנית "פגוש את העיתונות" בערוץ 2.
"אנו חשים שרמת האיום על הר הבית, במובן של ביצוע פיגוע על-ידי גורמים יהודים קיצונים ופנאטים, במטרה לטרוף את הקלפים ולהוות קטליזטור לשינוי כל התהליך המדיני - עלתה בחודשים האחרונים וביתר שאת בשבועות האחרונים, יותר מאי פעם", אמר השר לביטחון פנים.
"בהחלט ישנה סכנה שיירצו לעשות שימוש בעובדה שמדובר באתר הכי רגיש, הכי נפיץ והכי מקודש למוסלמים, כדי לבצע פיגוע על האתר עצמו, או במסגד או נגד מתפללים, ולאחר מכן לקוות שתגובת השרשרת תביא לקריסת התהליך המדיני... ישנן שפע של אינדיקציות - מאוד מאוד מדאיגות, שבתחום הזה, הר הבית, יש חשיבה תכליתית ולא חשיבה ברמת הפילוסופיה".
עוד דווח בערוץ 2, כי לפי שעה, אין מידע מדוייק אודות חשודים העוסקים בתכנון פיגוע מן הסוג הזה, אך יחד עם זאת, במערכת הביטחון, ובעיקר בשב"כ, שומעים באחרונה את השם הזה: 'הר הבית', בנשימה אחת עם תוכניות וכוונות לסכל את תוכנית ההינתקות.
כמו כן, היועצים המשפטיים במשטרה בודקים כעת, האם ניתן לבצע מעצרים מנהליים בקרב אותם גורמים קיצוניים, במטרה לשמר את השקט בהר הבית.
מפכ"ל המשטרה, שלמה אהרונישקי, אמר בראיון פרידה ל'ידיעות אחרונות', כי ביקש באחרונה ממפקד משטרת ירושלים, לעבור שוב על הרשימות של אלה המורשים לעלות להר הבית. זאת במטרה לאתר האם יש שם גורמים העלולים לבצע מעשים מן הסוג הזה. "ייתכן שנגד אותם הגורמים צריך יהיה לנקוט בצעדים כמו מעצרי מנע", אמר אהרונישקי.
באחרונה "מציפים" ראשי מערכת הביטחון את ההסלמה בקרב קבוצות יהודיות קיצוניות, על-רקע ההתקדמות בתוכנית ההינתקות.
ראש השב"כ, אבי דיכטר, אמר השבוע בוועדת חוץ וביטחון של הכנסת, כי גוברת התמיכה והלגיטימציה סביב הפגיעה בראש הממשלה שרון. "יש חומר מודיעיני על עשרות יהודים המייחלים למותו של ראש הממשלה, וסביבם יש עוד 150-200 במעגל החיצוני, שייתכן ומסכימים לכך רעיונית".