הרמטכ"ל שאול מופז, הורה להפסיק מיידית סימון מספרים על זרועותיהם של העצורים הפלשתיניים ממחנות הפליטים. כמו כן הוא הורה לחקור נושא זה, ולטפל באחראים לכך.
מופז הודיע על כך לחברי כנסת בישיבת וועדת החוץ והביטחון. הוא ציין כי לא ידע על ההליך הפסול של הרישום, וכי בכוונתו לברר מי נתן את ההוראה לעשות זאת. גם שר הביטחון בנימין בן-אליעזר אמר כי לא ידע על הליך הרישום.
הרמטכ"ל ושר הביטחון התבטאו בנושא בתגובה לשאלתו של חבר הכנסת יוסף לפיד, ניצול שואה.
ח"כ לפיד אמר: "כניצול שואה זהו דבר בלתי נסבל שחיילי צה"ל רושמים מספרים של עצורים פלשתינאים". לפיד הביעה תדהמה מהתנהגות המפקדים והחיילים שלקחו חלק במעשה ולא גילו רגישות לעניין.