הותר לפירסום, כי המשטרה הצבאית החוקרת וכן היחידות המרכזיות של מחוזות המרכז והדרום במשטרת ישראל פיענחו את הפריצה וגניבת הנשק בבסיס אגד הלוגיסטי של פיקוד מרכז, הסמוך לבסיס חיל אוויר "חצור". מדובר
בפרשה בה נגנבו למעלה מ- 40 כלי נשק וכן אמל"ח נוסף. נעצרו שמונה מעורבים תושבי המרכז, בינהם חייל צה"ל אשר שירת בבסיס והשתחרר לאחרונה משירות.
מחקירת המשטרה הצבאית החוקרת העלתה, כי בליל ה-26 בינואר פרצו אלמונים לנשקיה בבסיס והעמיסו כלי נשק על רכב מבלי שיתגלו על-ידי השומרים. דבר הגניבה נודה רק בשעות הבוקר ואז התגלה, לאחר ספירת המלאי, כי נגנבו שמונה מטולי טילים נגד טנקים, 16 רובי M-16 מקוצרים ו-18 רובי M-16 ארוכים.
עוד התברר, כי האזעקה בנשקיה נוטרלה, הגדר נקרעה וכן נתלש חלון בנשקיה וגנבי האמל"ח נכנסו פנימה תוך ניסור דלתות וסורגים.
מצה"ל נמסר, כי בחודשים האחרונים פעלה היחידה המרכזית לחקירות מיוחדות (הימל"מ) באופן אינטנסיבי בשיתוף עם ימ"ר מרכז ודרום לחקר הפרשה. דווח, כי החוקרים הצליחו לבסס תשתית ראייתית שהביאה לחשיפת המעורבים. במהלך החקירה הפעילה המשטרה סוכן סמוי אשר הצליח לרכוש חלק מכלי הנשק.
החקירה העלתה, כי שמונה תושבי המרכז, בינהם חייל אשר שירת ביחידה והשתחרר לאחרונה, הם החשודים בפריצה והגניבה.
מצה"ל נמסר, כי נתפסו מספר כלי נשק אשר נגנבו מהבסיס וכן כמויות של סמים. בימים הקרובים יובאו החשודים להארכת מעצר. גורמי צבא סיפרו, כי במהלך החקירה נעשה שימוש במערך מודיעיני נרחב וכן באמצעים טכנולוגיים ואמצעי חקירה סמויים וגלויים.
ובמקביל - נגנבים כלי נשק נוספים
כמו כן, עצרה משטרת משגב (א', 2.4.06) שלושה חשודים, בהם שני קטינים בני 17, תושבי היישוב עראבה, בחשד שגנבו שלושה מקלעים מסוג מא"ג ממוזיאון צה"ל בצומת גולני. כלי הנשק, ששניים מהם כבר אותרו, היו מוצבים על נגמ"שים במוזיאון. המשטרה ממשיכה לבדוק כיצד נגנבו ועל איזה רקע, פלילי או לאומני.
נציין כי בשנת 2004 נגנבו מצה"ל 152 כלי נשק (לא כולל רימונים וחומרי נפץ) ואולם צה"ל הצליח לשים את ידו על 115 מהם. בשנת 2005 נגנבו מצה"ל 208 כלי נשק שרק 86 מהם הושבו לידי צה"ל.
בסוף חודש פברואר 2006 הותר לפירסום, כי המשטרה עצרה את אייל פרחאת ומועתז פרחאת תושבי דליית אל כרמל, בשנות ה- 20 לחייהם. השניים חשודים גנבו רובה M-16 ואלפי כדורים מבסיס צה"ל באיזור הצפון ומכרו אותם ל"מתווך" תמורת 15 אלף שקלים. על-פי המידע, השניים חדרו לבסיס צבאי בצפון הארץ בו שירת עד לאחרונה אחד העצורים וגנבו רובה M-16 ואלפי כדורים אותם כאמור מכרו למתווך, סוחר באמל"ח גנוב, שהעביר הנשק לרשות הפלשתינית.
בחודש יולי נחקרו גם שתי חיילות המשרתות בבסיס אגד לוגיסטי השייך לפיקוד מרכז. הן נעצרו לחקירה בחשד לגניבת 3 רובי M-16 מבסיסן והעברתם לגורמים פליליים. משטרת ישראל עצרה בן מיעוטים המעורב בפלילים אליו הועברו כלי הנשק, אך הם עדיין לא אותרו.
בחודש דצמבר האחרון הודה חייל צה"ל כי גנב כלי נשק והעבירם לפלשתינים תושבי ג'נין. החקירה בנושא בעקבות הודעה בדבר היעלמות נשק מסוג רוס"ר M-16 מיחידת צה"ל בפיקוד הצפון. מצה"ל נמסר כי לאחר ביצוע פעולות חקירה אינטנסיבית והפעלת אמצעים מודיעיניים של המשטרה הצבאית החוקרת (מצ"ח), אותר החייל החשוד בגניבה.