בתחילת ינואר 2010 הוחל בביצוע שינוי ארגוני ברשות החברות הממשלתיות, החולשת על 96 חברות ובהן כמה מן הגדולות בישראל. ואולם, אומר מבקר המדינה, לא נמצאו ברשות מסמכים המתעדים תוכניות סדורות לקראת ביצוע השינוי, לפני השינוי היה דיון יחיד בהנהלת הרשות, והפועל היוצא שלו היה שסמכויות רבות מדי רוכזו בידי סגנית מנהל הרשות, לילי אילון. לדברי המבקר, זהו מצב בלתי תקין העלול לפגוע בתפקוד הרשות, בבקרה הפנימית ובירידה לפרטים.