רשם העמותות מבקש (27.3.16) מבית המשפט המחוזי מרכז לפרק את עמותת "רפאנו ונוושע", בטענה שהיא ממשיכה את פעילותה של עמותת "רפאנו" שפורקה בשל ליקויים חמורים בהתנהלותה, כולל מעילת ענק בכספיה.
העמותה הנוכחית הוקמה באוגוסט 2010 ומטרתה המוצהרת היא סיוע בעניינים רפואיים שונים. בראש העמותה הקודמת עמד הרב חיים שפירא, וחברי הוועד היו אביו, הרב שמואל שפירא, והרב יצחק וייס. לדברי הרשם, קיימת זהות ברורה בין שתי העמותות, הן מבחינת בעלי התפקידים והן מבחינת הפעילות, כך שעמותת "רפאנו" ממשיכה למעשה לפעול תחת כסותה של "רפאנו ונוושע".
עוד אומר הרשם, כי התנהלותה של העמותה כיום מטעה את התורמים, שכן היא יוצרת את הרושם שמדובר בעמותה הקודמת, וזעת אל ידי שימוש בכתובתה הפיזית, באתר האינטרנט שלה, בלוגו שלה, במוניטין שלה ובפרסומים שונים שלה.
בעמותת "רפאנו", ממשיך הרשם, התגלו בין היתר מעילה של מיליון שקל, נטילת הלוואות שלא לצורכי העמותה, חלוקת רווחים אסורה בכסות של "הנהלה וכלליות", העברת כספים לחברים בוועד ובוועדת הביקורת, רישום כוזב של תלושי שכר, העסקה פיקטיבית של עובדים ואי רישום הוצאות כדין.
לטענת רשם העמותות, באמצעות עו"ד מיטל סלע-דונגי, פעילותה של "רפאנו ונוושע" מהווה מרמה ומסכלת את פירוקה של "רפאנו". העמותה החדשה הוקמה בסמוך להחלטתו לפתוח בהליכי פירוק נגד העמותה הישנה, והרב חיים שפירא אינו רק "יועץ" בה כפי שדיווחה, אלא עומד בראשה. טרם הוגשה תגובת העמותה.