הרמטכ"ל, רב אלוף גדי איזנקוט, העריך כי ישראל תידרש עוד שנים ארוכות להתמודד עם הטרור וכי ההתפרקות המדינית האזורית מעצימה את היכולות של ארגוני הטרור.

"נמשיך להתמודד מול טרור עוד שנים ארוכות, ההבנה של המפקדים היא שהטרור הוא תופעה ממושכת בו אנו נלחמים באזורים שאנו שולטים בהם ומחוץ להם", אמר (יום ד', 29.6.16) באירוע לציון 40 שנה למבצע אנטבה שהתקיים במרכז יצחק רבין בתל אביב. "ההתפרקות המדינות מעצימה את היכולות שמגיעות לידי ארגוני טרור", אמר והוסיף כי בשמונת האחרונים אנו מתמודדים עם טרור אחר, אך התופעה היא אותה תופעה - "ניסיון להשיג הישגים באלימות", כלשונו.

איזנקוט ציין כי רק אמון גדול בין הדרג הצבאי לדרג המדיני יכול היה לאפשר הוצאה אל הפועל של מבצע שחרור החטופים הישראלים מאוגנדה. "הקשר בין המנהיגות הצבאית לאזרחית מאפשר את המבצע הזה ומאפשר מבצע שבמרחק הזמן של ארבעים שנה נראה כמבצע בו המציאות עולה על כל דמיון", ציין. עוד הוסיף כי גם היום יש דור מפקדים שפועל בצורה תחבולנית יוזמת ערכית ומוסרית.