ח"כ
ז'קי לוי הותיר את בית שאן, בה שימש כראש העירייה עד אוקטובר 2013, במצב כלכלי רעוע, וניהל במשך שנים רבות את העירייה בניגוד לכללי מינהל תקין ותוך אי-הקפדה על עקרונות היעילות והחיסכון.
מבקר המדינה,
יוסף שפירא, מדווח (יום ג', 22.11.16) על "ליקויים רבים, חלקם חמורים, בתפקוד העירייה ובפעילותה בנושאים שנבדקו: ניהול כוח האדם, ניהול הכספים, ניהול נכסי העירייה, ניהול הרכש וההתקשרויות".
בדצמבר 2015 הסתכם הגירעון השוטף של העירייה בכ-10.7 מיליון שקל, הגירעון המצטבר הגיע לכ-60.8 מיליון שקל לאחר קבלת מענקים להקטנת הגירעון בסך 33 מיליון שקל ברבעון האחרון של אותה השנה, ועומס המלוות המשוערך הגיע ל-45.3 מיליון שקל.
העירייה לא עמדה ביעדי ארבע תוכניות הבראה שעליהן חתמה בשנים 2011-2004. בשנים אלה מצבה הכלכלי של העירייה אף הורע, והגירעונות השוטפים והמצטברים שלה גדלו. תוכניות ההבראה הרבות שגיבש משרד הפנים בעבר לא סיפקו פתרון של ממש לבעיות המרכזיות במבנה התקציבי של העירייה, בייחוד לבעיה של העדר מקורות הכנסה יציבים, ובכך הן היו בלתי ישימות ונועדו לכישלון.
בספטמבר 2015 חתמה העירייה על תוכנית הבראה חדשה, ולצורך יישומה קיבלה ממשרד הפנים מענקים בסך 57 מיליון שקל. אולם העירייה לא עמדה ביעדים המרכזיים שנקבעו בתוכנית, כבר בתחילת יישומה. משרד הפנים מצידו לא בחן באופן מעמיק את יכולתה של העירייה לעמוד ביעדים מרכזיים שנקבעו בתוכנית, והגמיש את יעדי כוח האדם והשעות הנוספות כבר בתחילת יישומה.
עוד מצא שפירא, כי ראש העירייה הנוכחי, רפי בן-שטרית, התערב בעבודתה של היועצת המשפטית כתובעת העירונית נגד מבצעי עבירות בנייה, ובכך פגע בעצמאותה ובאי-תלותה, והוא המשיך בהתערבותו גם לאחר שהיועצת המשפטית הזהירה אותו שאסור לו להתערב בעבודתה. בן-שטרית טען בתגובה, כי התערבותו נעשתה
בתום לב והוא מבין ששגה.
מנכ"ל העירייה קלט לתפקיד מזכיר הוועדה המקומית ממלאת-מקום אשר לא עמדה בתנאי הסף למשרה. מדובר בבתו של יזם מוכר בעיר ואחייניתו של חבר מועצת העירייה, אך פוטנציאל ניגוד העניינים שלה לא נבדק - והוא התמשש. העובדת טיפלה בתיקי הבניין של אביה ושל בני משפחה אחרים וביצעה בהם פעולות בנושאים שבתחום אחריותה, כולל מתן היתר בנייה בלא שהתמלאו כל הוראות הבטיחות.
גזבר העירייה לא פעל כמתחייב להפסקת כהונתו של סגן ראש העירייה במועצת העירייה בשל חוב ארנונה בסך 42,000 שקל, הפוסל אותו מלכהן כחבר מועצה, ולא הודיע על החוב לממונה על המחוז במשרד הפנים. שפירא מציין, כי האיש פסול מאז 2008 מלכהן במועצת העיר.
העירייה השכירה נכסים שהיא בעלת זכויות עליהם בלי לחתום על חוזי שכירות; לא פעלה בנחרצות לגביית דמי שכירות וארנונה מהשוכרים; לא ביצעה בדיקות כדאיות כלכלית ושומות לקביעת דמי שכירות ראויים; לא ביצעה מעקב ופיקוח על מצב הנכסים, ולא מנעה פעולות בלתי חוקיות בנכסים. השוכרים חייבים לעירייה דמי שכירות וארנונה בסך 5.6 מיליון שקל.