על-פי התיקון לחוק המו"פ, שאישרה (יום ד', 29.7.15) הכנסת, בקריאה שנייה ושלישית, ירוכז כל נושא החדשנות בישראל תחת קורת גג אחת, שתהיה כפופה לשר הכלכלה ומופקדת על מדיניות וביצוע התמיכה הממשלתית במשאב החדשנות של ישראל.
לפי החוק שאושר, המדען הראשי במשרד הכלכלה ימשיך בתפקידו ויכהן כראש הרשות ויו"ר מועצת הרשות בוועדות התוכניות השונות שתפעיל הרשות. הרשות תחליף את לשכת המדען הראשי במשרד הכלכלה ואת העמותה הממשלתית מתימו"פ ותהווה הגוף המוביל המתכלל של נושא החדשנות בישראל בכפיפות לשר הכלכלה. החוק עבר אחרי שורה של דיונים קדחתניים אשר התנהלו בוועדת כספים במהלך השבועות האחרונים במסגרתם נדונו כל סעיפיו לעומקם ונשמעו דברי כל הגורמים הרלוונטיים ואף הוטמעו שינויים.
מוקדם יותר, נראה היה כי החוק בסכנת מעבר במהלך מושב הכנסת שזה עתה הסתיים, שכן יו"ר ועדת הכספים
משה גפני, איים כי יגיש רביזיה שתעכבו ותדרוש דיונים נוספים בוועדה. בעקבות המחלוקות האחרונות שנתגלעו, סוכמו הדברים הבאים: לגבי ההסתייגות של חברי הכנסת
רחל עזריה (כולנו) ו
אראל מרגלית (
המחנה הציוני) בעניין קביעת מקום הרשות בירושלים, התקבלה דרישתם שייאמר בחוק מפורשות שהרשות תוקם בירושלים לכל היותר בתוך 3 שנים מיום כניסת החוק לתוקף. הוסכם בעניין זה עם האוצר, כי ימוצה הליך ההידברות עם העובדים, על-מנת שעובדים שאינם מתגוררים בירושלים לא ייפגעו או שיפוצו בהתאם למידת הפגיעה בהם.
קובי אמסלם, הממונה על השכר באוצר, אמר ש"זה מותנה בהסכמת העובדים, כי זה מעל מספר מסוים של קילומטרים ואז זה יכול להיחשב כאילו זה נעשה בכפייה. לכן מכיוון שזה תאגיד שטרם קם ואין כאן את המנהל שלו עדיין, אז צריך מעקב אחר יישום החוק, כך שהקמת הרשות לא תתעכב בגלל אי-הסכמות לגבי המעבר לירושלים". גפני דרש ש"עובד שנפגע יקבל פיצוי מלא. לא נשאיר עובד שייפגע כתוצאה מזה שעשינו חוק".
עוד סוכם בהתאם לעמדת הוועדה, שתנאי והגמול שישולם לדירקטורים ברשות יאושרו בוועדת הכספים, על-מנת לוודא שמתקיים פיקוח ציבורי בעניין. בנוסף, הושג סיכום לפיו, בוועדת האיתור של נציגי הציבור במועצה של הרשות, יהיו נשיא התאחדות התעשיינים או מי מטעמו. כמו-כן, האוצר משך את ההסתייגות שלו לגבי הסעיף שהכניסה ועדת הכספים לחוק המחייב השגת הסכם קיבוצי עם העובדים עד שנה מיום כניסת החוק לתוקף.