סא"ל אלעד מרום, בנו של אלוף (מיל.) אלי (צ'ייני) מרום, הודח מתפקידו כסגן מפקד בסיס אשדוד של
חיל הים בעקבות בדיקת פוליגרף. זוהי דוגמה נוספת לכך שכלי זה עשוי להיות משמעותי ואף גורלי.
בדיקת הפוליגרף בוחנת שינויים פיזיולוגיים בתגובותיו של הנבדק (בדיקת לחץ דם, בדיקת נשימה, רמת הזעה, בדיקת מוליכות חשמלית של העור ובדיקת דופק). ההנחה היא, כי אין באפשרותו של הנבדק לשלוט על תגובות פיזיולוגיות טבעיות כאשר הוא משקר, והדבר יבוא לידי ביטוי במדדים אלו.
ההלכה הפסוקה קובעת, כי בדיקת פוליגרף אינה ראיה מהימנה דיה מבחינה מדעית. על כן נפסק, כי תוצאת בדיקה בפוליגרף אינה מהווה ראיה קבילה בבית המשפט. לו היה השימוש במכשיר הפוליגרף נקי מספקות - ודאי היה מתאפשר השימוש בו גם בהליך פלילי, וגם ללא סייגים בהליך האזרחי. עצם הגבלת קבילות בדיקת הפוליגרף מלמדת על הבעייתיות שבשימוש בו.
יש לזכור, כי מידת הדיוק המיוחסת למכשיר הפוליגרף היא לכל היותר 90%, כאשר לעניין 10% הנותרים - עלולים דוברי אמת להימצא כדוברי שקר ולהפך.
תוצאות הפוליגרף תלויות בין היתר ביכולתו של הבודק לבנות מערך שאלות המתאים לנבדק ולמקרה, וכן מיכולתו לפענח את תוצאות הבדיקה, לרבות מיומנותו בנטרול ההתרגשות מתוך תוצאות האמת.
בהעדר חוק המסדיר את ההסמכה לביצוע בדיקות פוליגרף, כל אחד רשאי למעשה לבצע בדיקת פוליגרף, אף ללא הכשרה מעמיקה. כפועל יוצא מכך, הפערים בהכשרותיהם של בודקים שונים, הרקע המקצועי שלהם, ניסיונם המקצועי ומיומנותם בהגדרת השאלות נשוא הבדיקה, ואופן ניתוח התוצאות על ידם - עלולים להביא לתוצאות הפוכות בבדיקת הפוליגרף.
נטילת תרופות הרגעה לפני בדיקת פוליגרף עשויה גם היא להשפיע על תוצאות הבדיקה. לכן, לפני בדיקת הפוליגרף על הבודק לבצע טסט מקדים לנבדק, על-מנת לקבוע את רמת הרגישות שלו כאשר הוא משקר. יש גם נבדקים אשר ניחנו ביכולת גבוהה לשלוט על תגובותיהם הפיזיולוגיות, והם קשים לבדיקה וקבלת תוצאות אמינות.
בדיקות הפוליגרף משמשות בהליכים פליליים בשלבי חקירה, לצורך החקירה ולצורך גיבוש המלצות. בדיקת פוליגרף יכולה לסייע באיתור חשודים או בניקוי חשד מחשודים אחרים, וכן לסייע בחקירה, אך אינה קבילה כראיה בהליך עצמו. גם בחקירה לא ניתן לבצע בדיקת פוליגרף אלא בהסכמת הנחקר, ואם הבדיקה מצביעה שאינו דובר אמת - זכותו לבקש בדיקה נוספת בידי בודק אחר.
גם בהליך אזרחי, בדיקת הפוליגרף תהיה קבילה רק בכפוף לשני תנאים מצטברים. האחד: הסכמת שני הצדדים מפורשות, מראש ובכתב, על עריכת הבדיקה כאשר הנבדק מסכים מרצונו החופשי להיבדק במכשיר הפוליגרף ושתוצאות הבדיקה יהוו ראיה קבילה בבית המשפט. השני: התוצאות הן חד-משמעיות. רק בהתמלא שני תנאים אלו, יכול (אך לא חייב) בית משפט בהליך אזרחי לקבל את תוצאות בדיקת הפוליגרף. כמו-כן, נעשה שימוש בבדיקות אלו בבחינות תעסוקתיות, בתביעות גירושין ועוד.
לאור כל אלו, מכשיר הפוליגרף הוא כלי חשוב, אשר שימוש בו עשוי להוביל לחקר האמת וחשיפתה, ברם אין לאפשר מצב בו יקום הגולם על יוצרו, ואין לחרוץ גורלות ועתידות אך ורק על סמך מכשיר הפוליגרף. אם אדם הודח מתפקידו רק בעקבות בדיקת פוליגרף - זוהי החלטה בעייתית.