שר הביטחון אהוד ברק שיעבד אינטרסים ביטחוניים לטובת אינטרסים פוליטיים. הוא העלה את ישראל על עץ גבוה, בעניין האירני, ולאחר מכן ברח והציג עצמו בפני הממשל האמריקני כאיש שדווקא ממתן את ראש הממשלה בנימין נתניהו ומוכן לוותר. כך תקף המשנה לראש הממשלה, השר משה (בוגי) יעלון, באירוע שבתרבות ברמת גן (יום שבת, 13.10.12).

יעלון, המצוי ביריבות עם ברק בשנים האחרונות, הטיל על ברק את האחריות למשבר בינו לבין נתניהו. "קרה משהו בסיפור האירני שהוא בהחלט לא תקין", אמר, "ולכן ראש הממשלה זעם על שר הביטחון. הוא העדיף שיקולים פוליטיים על פני שיקולים לאומיים". השר אמר כי הוא דוגל בהפעלת סנקציות נוספות נגד אירן, בתקווה שיכריעו את הנהגתה, אך בהכנת אופציה צבאית משכנעת.

יעלון ציין, כי נתניהו וברק פעלו יחד במשך זמן ממושך. הם הובילו קו שאומר: הפצצה לפני פצצה. ברק אף ערך תדרוכים לכלי התקשורת, בהם התריע מפני פרויקט הגרעין האירני ואף הוביל למסקנה לפיה אין מנוס מתקיפה ישראלית אם זו לא תבוצע על-ידי ארה"ב.

"שר הביטחון העלה את מדינת ישראל על העץ", קבל יעלון, אבל, "ברגע האחרון הוא ברח ועוד הציג את עצמו כמתון", וכל זאת כדי לקבל נקודות גם בארה"ב ולהשפיע על הבחירות בישראל. יעלון האשים את ברק בהתנהגות פחדנית והזכיר: כשכיהן כרמטכ"ל, ברח ברק באופן דומה גם בפרשת צאלים, כשהטיל את כל האחריות לאסון על פקודיו.

"זה היה מעשה שלא ייעשה", התריע יעלון על התנהלותו של ברק בפרשת הגרעין האירני, והזהיר מפני התנהלותו הקלוקלת גם בעניינים אחרים, ובהם בפרשת הרפז. הייתה כאן התנהלות בלתי ראויה מול הרמטכ"ל, גבי אשכנזי. "הייתה פונקציה של גחמות פוליטיות שפגעה במוסד הרמטכ"לות".