המרכז להנצחת מורשת גוש קטיף וצפון השומרון הקים קרן למימון מחקרים אקדמיים העוסקים בגוש קטיף וצפון השומרון. המרכז מציע לסטודנטים להגיש מועמדות למלגות מחקר בנושא סיפורו של גוש קטיף, ממגוון היבטים וזוויות הקשורות לתחומי מחקר בדיסציפלינות השונות: פסיכולוגיה, סוציולוגיה, כלכלה, מדעי המדינה, יהדות, משפטים, היסטוריה, אמנות וכולי.