לראשי 12 רשויות מקומיות ולסגניהם ניתנו הטבות בשכר ובתנאים הנלווים, החורגות, לעתים חריגה ניכרת, מההנחיות שקבע בעניין משרד הפנים. לעיתים ניצלו חלק מראשי רשויות את מעמדם כדי לקבל טובות הנאה. כך קובע (יום ד', 8.5.13)
מבקר המדינה,
יוסף שפירא.
ראש עיריית אור יהודה, דוד יוסף, העלה בהיכל התרבות העירוני בעיר מופע סטנד-אפ בניב העירקי של הערבית, תוך קבלת הטבות חריגות מהמרכז הקהילתי בעיר ובלי שקיבל את אישורם של מועצת העירייה ומשרד הפנים לעיסוק נוסף.
ל-21 חברי מועצה בשש רשויות מקומיות (עיריות אום אל-פחם, אור יהודה, עכו ורהט, מועצה מקומית עראבה ומועצה איזורית הגלבוע) היו בסוף שנת 2011 חובות תשלומי מיסים (ארנונה, מים ואגרות). הרשויות לא השתמשו בסמכותן להפסיק את חברותם של החייבים במועצות, אף שהדבר נדרש על-פי החוק. עיריית עכו העבירה בשנים 2011-2009, באמצעות מתנ"ס שאיננו עירוני, כספים לשתי עמותות ששני חברי מועצה היו מעורבים בפעילותן.
נמצאו חריגות בקשר לרכישת רכב חדש עבור ראשי חמש רשויות מקומיות: ראש עיריית רמת השרון, יצחק רוכברגר; המועצה המקומיות בנימינה-גבעת עדה, אורי דיסטניק; ראש המועצה המקומית להבים,
אלי לוי; ראש המועצה האיזורית הגלבוע, דני עטר; וראש המועצה האיזורית שומרון, גרשון מסיקה.
מרבית ראשי הרשויות המקומיות שנבדקו הגישו בקביעות חשבוניות "כיבוד ואירוח" במסעדות, מרביתן שלא בגין אירוח רשמי, והרשות נשאה בעלות הוצאות האירוח, אף שנבחרי ציבור אלה קיבלו במשכורתם סכום גלובלי עבור הוצאות אש"ל או שקיבלו החזר הוצאות אש"ל.
כמעט כל הרשויות המקומיות שנבדקו מימנו עבור נבחרי הציבור בהן פעילויות שלא פורטו בחוזרי מנכ"ל משרד הפנים בין הפעילויות שעליהן לממן, כגון השתתפות בימי עיון ובכנסים. לרוכברגר ניתנה הלוואה מקרן ההלוואות של עובדי העירייה כדי לממן את הוצאות לימודיו לתואר שני.
כמה לשכות של ראשי רשויות מקומיות יזמו פרסומים בעלי אופי תדמיתי, אשר הבליטו את שמו ואת פועלו של ראש הרשות, ואשר היו בהם מאפיינים ומסרים שהם באורח חד-משמעי תעמולת בחירות - אף שלפי הנחיית היועץ המשפטי לממשלה אין לממן פרסומים כאלה מקופתה של הרשות המקומית.
משרד הפנים לא הסדיר שורה ארוכה של נושאים הנוגעים לתנאי העסקתם של ראשי הרשויות וסגניהם: היעדרות בשל מחלה; גודל המשלחת שניתן לארח בעת אירוח רשמי ותקרת ההוצאות באירוח כזה; נזקים לכלי רכב שנגרמו עקב תאונות שעשו הנבחרים; השתתפות בתשלום עבור השתלמויות וכנסים שהשתתפו בהם; הוצאות בגין כתיבת נאומיהם; סדרי הדיווח שיהיו חייבים בהם לפני נסיעותיהם לחו"ל ולאחריהן.
משרד הפנים גם החליט על דעת עצמו להעניק לראשי רשויות ולסגניהם שפרשו מתפקידם הטבות שהיו טעונות אישור ועדת הפנים של הכנסת. בהטבות אלה נכללו מענק הסתגלות, עיתון יומי וקביעת הסדרים חדשים להחזר הוצאות טלפון.
שפירא דורש מן הרשויות להקפיד על קיום העקרונות הבסיסיים של מינהל תקין, לרבות שקיפות וחיסכון, ולבצע תשלומים לנבחרים רק בהתאם לנהלים. כמו-כן, דורש שפירא לגבות בחזרה סכומים ששולמו שלא כדין ולפעול מדי שנה לגביית חובותיהם של חברי מועצה בגין מיסים מקומיים.