בשנים שקדמו למבצע צוק איתן בקיץ 2014 ובמהלך המבצע עצמו, התגלו ליקויים חמורים בהיערכות ובהתמודדות מול איום המנהרות מרצועת עזה לתוך שטח ישראל. זוהי מסקנתו של מבקר המדינה, יוסף שפירא, בטיוטת הדוח שלו בנושא.

שפירא הורה (יום ה',4.2.16) לאנשי משרדו להעביר את הטיוטה לעיונם של ראש הממשלה, בנימין נתניהו, שר הביטחון, משה יעלון, והרמטכ"ל, גדי איזנקוט. זאת, לנוכח מה שהגדיר "הדחיפות המסתמנת בנושא המנהרות בכל החזיתות". נתניהו ויעלון כיהנו בתפקידיהם גם בזמן "צוק איתן".

כותרתו של הדוח היא "היערכות מערכת הביטחון לאיום המנהרות בהיבטי מודיעין, בניין הכוח והפעלתו". הביקורת הראשונית בנושא החלה עוד בפברואר 2014, כחצי שנה לפני המבצע במהלכו התברר היקף איום המנהרות על יישובי עוטף עזה ועל חיילי צה"ל באיזור.

כעת מדובר בחלק ממטלת ביקורת רחבה בעקבות מבצע צוק איתן, שמתבצעת מאז ספטמבר 2014 בחטיבה לביקורת מערכת הביטחון במשרד מבקר המדינה. בקרוב תועבר לנתניהו, יעלון ואיזנקוט טיוטת פרק נוסף בדוח, שמתמקד בביקורת על תהליכי קבלת ההחלטות בקבינט המדיני-ביטחוני ותפקודו וכן ביחסי הגומלין בין הקבינט לבין הדרג הצבאי כולל בקשר לאיום המנהרות. שאלת המענה הטכנולוגי לאיום המנהרות תטופל בנפרד.

משרד מבקר המדינה מסר, כי בין יתר הפרקים בדוח על "צוק איתן" יהיו אלו: היערכות לשם הגנה על העורף האזרחי מפני איום טילים ורקטות; ופעילות צה"ל בקשר להוראות הדין הבינלאומי.