שופט בית המשפט המחוזי בירושלים, משה יועד הכהן, דחה ללא קביעת מועד חדש את מתן המענה של הרב יונה מצגר לכתב האישום נגדו. לטענת המדינה, ההחלטה התקבלה בלא שהיא כלל התבקשה להגיב על בקשתה של ההגנה לקבל דחייה.

המדינה מסרה (21.9.16) להכהן את תשובתה לטענות ההגנה בדבר העדר חומרי חקירה, והיא דוחה טענות אלו. בשולי התשובה מציינת המדינה את החלטתו של הכהן, שניתנה ככל הנראה כ"החלטת פתקית" שאינה פתוחה לעיון ואף לא פורסמה ברבים.

הפרקליטות אומרת, כי למעט מסמכים בודדים - כל חומר החקירה המצוי בידיה כבר הועבר לסניגוריו של הרב הראשי לשעבר, המואשם בקבלת שוחד ב-10 מיליון שקל. חלק מן החומר הועבר לפני זמן רב, ממשיכה הפרקליטות, לפני שהרב מצגר החליף את סניגוריו. לדבריה, היו רק חוסרים בודדים בדיסק של חומר החקירה הסרוק, שהועבר להגנה בסוף חודש אוגוסט, והם הושלמו; חומר החקירה כולו צולם עוד קודם לכן.

המדינה משיבה בצורה פרטנית על טענות ההגנה ואומרת בין היתר, כי כל הודעותיהם של העדים בכלל ושל עד המדינה בפרט, כבר הועברו להגנה. הפרקליטות מאשרת שכמה מנותני השוחד לכאורה לא נחקרו, ואומרת שהיה זה משום שלא אותרו, "כפי שקורה בתיקים רבים". רק צווי האזנות הסתר טרם הועברו להגנה, משום שהפרקליטות טרם קיבלה אותם מהמשטרה, והיא תסרוק אותם מיד כאשר תקבל אותם.

לסיום מבקשת הפרקליטות מהכהן לקבוע מועד חדש וקרוב לקבלת המענה של הרב מצגר לכתב האישום. שמיעת ההוכחות בתיק אמורה להתחיל בראשית חודש ינואר - 15 חודשים לאחר הגשת כתב האישום - אך לא ברור אם כך יהיה, לנוכח הדחיות והמחלוקות המתמשכות בין הצדדים. תשובת המדינה הוגשה באמצעות עוה"ד דניאל ויטמן ואילה גלברד-יעקב.