ראש המוסד יוסי כהן, שעמד בראש המל"ל במהלך מבצע צוק איתן, טען כי הוא אינו יכול לקבל את הקביעה שחברי הקבינט לא ידעו או לא הבינו את כל המידע הנוגע למבצע. זאת, בניגוד לדוח
מבקר המדינה שהעלה טענות בנושא זה.
"לחברי הקבינט היה המון מידע גם בחודשים שלפני צוק איתן. הקבינט קיבל המון סקירות מכל הגורמים הרלוונטיים. היו עשרות דיוני קבינט במהלך צוק איתן כולל לפעמים פעמיים ביום. קשה לי לקבל את הקביעה שחברי הקבינט לא ידעו, לא הבינו או שלא היה בפניהם כל המידע. כל חבר קבינט יכול בכל רגע נתון לבקש מידע ואין נושא שכלל לא היה ידוע לשרים", אמר (יום א', 19.3.17) בדיון שהתקיים בוועדה לביקורת המדינה בכנסת בנושא דוח המבקר על מבצע צוק איתן.
לדברי כהן, יש אובססיה בנושא הדיון בחלופות הפעולה הנוגעות לרצועת עזה. "אחרי שמחליטים ללכת לכיוון מסוים אז כבר נגמר עניין החלופות ולפעמים בכלל אין חלופות, אלא אם נוצרה תפנית אסטרטגית בהערכת המצב", טען.
לטענת כהן, צריך להסתכל על עבודת המל"ל באופן רחב יותר מאשר נקודתית על ההתנהלות צוק איתן. "למשל במבצע שובו אחים, בזירה המדינית בסוגיית שיתוק נתב"ג במהלך המבצע. ממליץ לכולם ללמוד את עבודת המל"ל עוד מתחילת 2014 ועד לשוך הקרבות", אמר.