קיימות ראיות לכאורה שהמשנה לשעבר לראש המטה לביטחון לאומי, אבריאל בר-יוסף, קיבל שוחד מאיש העסקים הגרמני מייקל הרצוג ובתמורה קידם את עסקיו, בין היתר בוועדת צמח בה היה חבר ואש דנה במתווה הגז - סבורה המשטרה (23.11.17) עם סיום החקירה נגד בר-יוסף. מדובר בחקירה נפרדת מזו המייחסת לבר-יוסף עבירות בפרשת כלי השיט.
הפרשה נחשפה לראשונה ב-News1 בעקבות מכתב ששלח יו"ר הנהלת אומ"ץ,
אריה אבנרי, לנציב שירות המדינה דאז, משה דיין, אשר טען כי מידע ממקורות שונים מגלה כי בשנים 2011-2013 נסע אבריאל פעמים אחדות לגרמניה ולפורטוגל על חשבון מייקל הרצוג, איש עסקים מקומי מפוקפק, שכיום יושב בכלא הגרמני על מירמה והונאה. במסגרת נסיעותיו היה אבריאל מעורב בפרויקט לרכישת מספנה בפורטוגל, וביוזמה להקמת מפעל צף לדחיסת גז נוזלי ממאגר תמר.
לדעת המשטרה, קיימות ראיות להאשים את בר-יוסף בעבירות של קבלת שוחד,
הלבנת הון ומרמה והפרת אמונים. החקירה עסקה במעשים שבוצעו לכאורה כאשר בר-יוסף שימש כסגן ראש המל"ל וכמשנה לראש המטה, ואף בתקופה בה ביצע חפיפה לקראת כניסתו לתפקיד ראש המל"ל. המשטרה אומרת, כי בר-יוסף פעל תוך שיתוף אחרים והסתייעות בהם, ששמותיהם לא נמסרו.
על-פי החשד, בר-יוסף קיבל שוחד מהרצוג, שהשקיע מאות אלפי אירו בחברה הנמצאת בבעלות קרובת משפחתו. לכך הצטרפו הטבות נוספות שוות ערך והבטחות למתן טובות הנאה עתידיות. בתמורה, כאמור, הוא קידם אינטרסים עסקיים של הרצוג, אשר ביקש לקדם מיזם להנזלת גז טבעי. התיק יועבר בימים הקרובים לפרקליטות, אשר תחליט האם להגיש כתב אישום. בר-יוסף הוא תת-אלוף במילואים, אשר שירת 25 שנה בחיל-הים עד לתפקיד ראש מספן ציוד, והיה גם מנהל ועדת החוץ והביטחון בכנסת - תפקידים הקושרים אותו לפרשת כלי השיט.