שר התחבורה והבטיחות בדרכים, ישראל כ"ץ, החליט בהתייעצות עם שר האוצר,
משה כחלון להמליץ על מינויו של
דן הראל לתפקיד יו"ר חברת
רכבת ישראל. המינוי כפוף לאישור דירקטוריון החברה.
בשנת 2010 מונה דן הראל לתפקיד מנכ"ל
משרד התחבורה. להראל היו חילוקי דעות עם השר ישראל כ"ץ שהביאו לפרישתו של הראל בטריקת דלת. לאחר מכן שימש הראל כמנכ"ל משרד הביטחון.
החלטת השר כ"ץ להמליץ על מינויו של הראל לתפקיד יו"ר הרכבת נועדה, לדבריו, להעניק תנופה לפעילות הרכבת ולסייע לה במימוש מדיניות שר התחבורה ובעמידה ביעדים, בתחום רמת השירות והביצוע. המשימה הראשונה של הראל תהיה לוודא כי הרכבת המהירה לירושלים, תחל את פעילותה המלאה עד לערב ראש-השנה, בהתאם להנחיית השר.
כ"ץ הסביר כי החליט להמליץ על מינויו של הראל לתפקיד בשל ניסיונו הרב בניהול מערכות גדולות ומורכבות. "הראל צבר ניסיון רב בניהול פרויקטים מורכבים ומיזמים ייחודיים, גם ברכבת ישראל ויסייע לה לעמוד באתגרים הגדולים הניצבים בפניה, בהתאם ליעדים שנקבעו על-ידי", אמר כ"ץ. לדבריו, בפני הרכבת ניצבים אתגרים גדולים, הכוללים בין השאר את המשך תנופת הפיתוח של הרכבת והקמת תשתית מסילתית בכל רחבי
הארץ, לצד העלאת רמת השירות לרמה הבינלאומית המקובלת.
הראל מכהן כיום כיו"ר דירקטוריון חברת נתיבי איילון, לאחר שמונה לתפקיד על-ידי השר כ"ץ, כדי לקדם את הקמת תשתית התחבורה הציבורית בגוש-דן.
במסגרת 36 שנות שירותו הצבאי שימש הראל בין השאר כסגן הרמטכ"ל, אלוף פיקוד דרום וראש אגף מבצעים במטכ"ל.