שלוש שנים אחרי חטיפת שלושת הנערים - גיל-עד שער, נפתלי פרנקל ואיל יפרח - לא השלים מחוז יהודה ושומרון של המשטרה (מחוז ש"י) את יישום כל הלקחים מן המקרה, מגלה (יום ד', 14.3.18)
מבקר המדינה,
יוסף שפירא. מדובר במיוחד בלקחים הנוגעים למרכז השליטה המחוזי (המשל"ט), ושפירא מטיל על המפכ"ל
רוני אלשיך את האחריות לפעול בדחיפות לנקיטת הצעדים הנדרשים כדי להביא לשיפור בתפקוד משל"ט מחוז ש"י.
סיפוח שוטרים למשל"ט בשנים 2016-2014, שעל-פי תקן המחוז היו אמורים לבצע תפקידים אחרים, בלא שקיבלו את ההכשרה הנדרשת לכך, נוגד את הנהלים של המשטרה ונוגד את ההתנהלות הנדרשת על-פי פקודת הארגון הקיימת. בסיפוח זה יש משום פגיעה בכללי מינהל תקין, והדבר עלול לגרום לפגיעה בתפקודו של המשל"ט בעת הצורך.
משל"ט ש"י נמצא במבנה שאינו ממוגן. למחוז אין אתר מאותר להפעלת מוקד חלופי שאליו תעבור פעילותו בעת שיתעורר צורך לכך בשעת חרום, כנדרש על-פי נוהלי המשטרה. דבר זה עלול לפגוע במבצעיות של המחוז וביכולתו לשלוט במרחב שבאחריותו ולנהל את פעילותו, מזהיר שפירא.
שפירא מעיר למשטרה, כי אחד הלקחים המרכזיים שעלו מתחקור אירוע "שובו אחים" הוא, כי יש צורך לשפר את תפקודם של מוקדי 100, בדגש על שיפור טכנולוגי של המרכזיות, בהתאם לתפיסות ההפעלה בהיבטים של פיקוד ושליטה, ולכן על המשטרה לקדם בהקדם האפשרי את הטיפול בצעדים שטרם בוצעו.
פקודת הארגון של מחוז ש"י לא עודכנה במשך 16 שנים, בניגוד להוראות המשטרה. הפקודה הלא-מעודכנת הופכת למסמך חסר משמעות, אשר אינו מבטא כלל את האופן בו מאורגן המחוז - קובע שפירא. אי-עידכון הפקודה במשך תקופה כה ארוכה, בייחוד נוכח השינויים הרבים בהיקף הפעילות ובאופן פעילותו של מחוז ש"י, עלול לפגוע ביכולת המחוז לבצע את משימותיו באופן מיטבי.
מחוז ש"י מפעיל לצורך משימותיו כלי רכב ממוגני ירי מסוג מסוים, אשר אינם מתאימים לחלק ממשימות השיטור של המחוז. במועד סיום הביקורת טרם הסתיימה עבודת המטה להצטיידות ברכבים ממוגני ירי קלים, והמחוז טרם החל להצטייד ברכבים ממוגני ירי קלים. עוד מגלה המבקר, כי נכון לספטמבר 2016 - רוב אפודי המגן נגד ירי נשק קל במחוז ש"י אינם עומדים בדרישות היצרן. עיכוב בחידוש מלאי השכפ"צים הקרמיים עלול לפגוע ביכולתם של השוטרים לבצע את משימותיהם ואף עלול לסכן את חייהם, מזהיר שפירא.
במשך שנים רבות חקר מחוז ש"י בעצמו את שוטרי מג"ב במקרים של אירועי ירי שבהם גרמו לפציעה או למוות של פלשתינים באיו"ש. חקירות אלה נערכו משנת 2007, בניגוד לפקודת המשטרה ובקצב איטי במיוחד. רק בנובמבר 2017 החליט ראש הממשלה,
בנימין נתניהו, כי הטיפול בתלונות אלו נגד שוטרי מג"ב תועבר לידי מצ"ח.
שפירא מסכם: "בביקורת נמצאו ליקויים, מהם מהותיים ומשמעותיים, באופן תפקודם של המטה הארצי ומחוז ש"י בנוגע לארגון ולתקינה של כוח אדם והציוד במחוז ולאופן פעילותו של מוקד 100, שיש בהם כדי לפגוע בבניין הכוח, בהפעלתו, ברמתו המקצועית ובכשירותו המבצעית. נוסף על כך נמצאו ליקויים בכל הנוגע לקשר ולשיתוף הפעולה בין המחוז לבין צה"ל ושב"כ, שיש בהם כדי לפגוע ביכולת המחוז למלא את משימותיו".