האגודה לזכויות האזרח מבקשת מבג"ץ (יום א'], 23.12.18) לבטל את חוק הלאום, בטענה שהוא מפלה לרעה את המיעוט הערבי. בכך מצטרפת האגודה לגורמים קודמים שעתרו נגד החוק, בעיקר מן המגזר הערבי.
לטענת האגודה, החוק כולל "הסדרים גורפים ופוגעניים ברמה הסמלית, המשפטית והפרקטית, המקבעים והמחדדים את ההיררכיה המעמדית שהייתה קיימת בפועל ערב חקיקת החוק בין האזרחים היהודים לערבים במדינה, ומכפיפים באופן מסוכן וחסר תקדים את זהותה של ישראל כמדינה דמוקרטית להגדרה הלאומית היהודית, מאיימים על זכויות האדם הקולקטיביות והפרטיות של כלל האזרחים, ופוגעים באופן בוטה בזכויות המיעוט הערבי".
האגודה אומרת, כי הסעיף בדבר "מימוש הזכות להגדרה עצמית לאומית במדינת ישראל ייחודי לעם היהודי", מנוגד לנורמות המשפט הבינלאומי המכירות בזכותם הבסיסית של מיעוטי מולדת
להגדרה עצמית במסגרת מדינות רוב לאומי. הגדרת העברית כשפה רשמית בעוד שלערבית ניתן מעמד מיוחד, מהווה נישול של הערבים, נטען בעתירה.
לדבריה, סעיף ההתיישבות היהודית (המוגדרת כ"ערך לאומי" שהמדינה תעודד) הוא המסוכן ביותר בחוק, שכן הוא יביא בתוך זמן קצר "להחמרה ולהחרפה בהפליה הממסדית והמתמשכת, המעשית, הממשית ומרחיקת הלכת בחלוקת הקרקע והמשאבים במדינה בין היהודים לערבים, יהפוך את ההפליה לערך מערכי השיטה המשפטית והנורמטיבית בישראל, ויפגע באופן חסר תקדים בזכויות הבסיסיות של המיעוט הערבי בישראל לשוויון, לדיור, לקרקע, לבריאות, לחינוך, והחשוב מכל: ל
כבוד ולחיים בכבוד". העתירה הוגשה באמצעות עוה"ד דן יקיר, רגד ג'ראיסי, סנא אבן-ברי וגיל גן-מור.