אל"מ עאטף זאהר נידון לשש שנות מאסר ושנתיים על תנאי, וכן להורדתו לדרגת טוראי. עאטף יפצה את המתלוננת בסכום של 35,000 ש"ח. כך קבע (יום ו', 29.9.06) בית הדין הצבאי לערעורים בקרייה.
צוות השופטים, בראשות אלוף ישי בר, קבעו בהחלטתם כי אל"מ זאהר "רמס בגסות את גוף המתלוננת, הפך אותה לאובייקט מיני, עשה שימוש אפל בתמימותה לסיפוק יצריו המיניים".
בית הדין ציין בדבריו, כי "חיילי צה"ל זכאים לכבוד, להגנה על זכויותיהם, לחירות ולאוטונומיה על גופם, בכל עת. זכותם לסרב לקיום יחסי מין לעולם עומדת... עבירות מין המתבצעות בתוך המערכת הצבאית פוגעות בביטחונם האישי של קורבנות העבירה ואינן מאפשרות קיומה של סביבה שיוויונית, סביבה בה יחושו נשים המשרתות בצה"ל בטוחות ומוגנות". עוד הוסיף בית הדין וציין, כי "מעשיו סוטים סטייה ניכרת מערכי היסוד המקובלים בצה"ל ומעידים כמאה עדים על חומרת כישלונו כמפקד, כחייל וכאדם".
אל"מ עאטף זאהר, מי ששימש כראש מנהל אוכלוסיות מיוחדות באגף כוח אדם, הורשע בחמש עבירות של אונס של חיילת שהיתה תחת פיקודו. סניגורו, עו"ד אביגדור פלדמן, הודיע כי יערער על ההחלטה לבית המשפט העליון, אלא שבית הדין לערעורים דחה את בקשתו. תחילת ריצוי העונש נדחה ל- 29.10.06.
בחודש יולי האחרון הרשיע בית הדין הצבאי לערעורים, בהרכב השופטים ישי בר, דבורה ברלינר ומרים גור אריה, את אל"מ עאטף זאהר באונס חיילת שהיתה תחת פיקודו. זאהר, שזוכה בעבר מעבירת האונס בבית הדין הצבאי והורשע במעשים מגונים, הורשע בערכאת הערעור בכך שאנס את החיילת ששירתה תחת פיקודו לפחות תשע פעמים. כמו כן, הורשע בעבירת התנהגות שאינה הולמת.
הפרשה נחשפה בשנת 2004 על-ידי כתבת "קול ישראל", כרמלה מנשה. חיילת ששירתה תחת פיקודו של אל"מ זאהר, התלוננה כי הקצין הבכיר הפך אותה לשפחת מין ואנס אותה בלא פחות מ-14 מקרים. מלבדה, התלוננו נגד זאהר עוד שתי נשים נוספות שטענו כי ביצע בהן מעשים מגונים.
בעקבות תלונותיה, הגישה הפרקליטות כתב אישום חמור במיוחד נגד זאהר, אשר כלל עבירות אונס ומעשים מגונים תוך ניצול מרות. כמו כן, הואשם זאהר באיומים על החיילת שלא תספר לאיש על המעשים האסורים. "אם מישהו יידע", איים הקצין, "יקרה לך משהו רע".
