מבקר המדינה השופט (בדימ.) מיכה לינדנשטראוס, גילה חשד לעבירות פליליות בתקופת כהונתו של אביגדור ליברמן כשר התחבורה, וגם לאחר מכן - לאחר שכבר פרש מתפקידו. מדובר במינויים שנעשו לכאורה בניגוד לחוק, תוך העדפות פסולות, מסיבות אישיות וזרות ומסיבות פוליטיות. ככל הידוע, המבקר עומד להעביר בקרוב מידע זה לידי היועץ המשפטי לממשלה.
המידע המחשיד את ליברמן התחדד באחרונה, בעקבות מידע חדש שהובא לידי משרד מבקר המדינה. מהמידע עולה, כי לחברה החדשה שהוקמה במקום מע"צ (שפעלה כיחידת סמך) הועדפו מקורבים, וזאת משיקולים זרים. עשרות מינויים בוצעו שלא כדין, ותופעה זו נמשכה גם לאחר יוני 2004 - לאחר שליברמן סיים את תפקידו כשר התחבורה. מתברר, כי אנשיו של ליברמן, שכבר "ישבו" בחברה, המשיכו לסדר למקורבי ליברמן תפקידים בכירים. מהכיבודים נהנו פעילים בכירים בישראל ביתנו וגם מקורבים לחברי מרכז הליכוד, בעלי זיקה לליברמן.
להלן כמה דוגמאות שהוצגו על-ידי אותם גורמים, בפני מבקר המדינה:
- בוריס אברמוב מונה לתפקיד ממונה מסירת עבודות. אברמוב הינו שכנו של ליברמן ופעיל בכיר במפלגת ישראל ביתנו. על-פי המידע שהועבר למבקר, מונה אברמוב מתוך שיקול זר ובהליך בלתי תקין;
- עו"ד סימה לוי, בתו של השר לשעבר דוד לוי, מונתה לתפקיד רכז משפטים, למרות שלא היה לה ניסיון קודם בתחום זה. על-פי המידע שהובא ל-Nfc, בן זוגה של לוי הינו פעיל בכיר בקבוצה המקורבת לליברמן;
- עו"ד דנה חכים, בתו של חבר מרכז הליכוד גרשון חכים, מונתה לתפקיד ממונה שיווק ופיתוח עסקי. כדי לעקוף את נהלי החברה היא נשכרה באמצעות חברת כוח אדם;
- עו"ד אלכסנדר פנחסוב מונה לפרקליט במחלקה המשפטית. גם הוא נשכר באמצעות חברת כוח אדם, וזאת מתוך שיקול זר ובניגוד לנהלים;
- עו"ד מירב דימרי נשכרה באמצעות חברת כוח אדם. מהמידע שהובא בפני מבקר המדינה עולה, כי דודה, הנרי דימרי, ואביה, מיכאל דימרי, הינם חברי מרכז הליכוד;
- יאנה גינזבורג מונתה לתפקיד קולטת עובדי חשבות. גינזבורג נחשבת לפעילה בכירה בתנועת ישראל ביתנו, בראשה עומד ליברמן.
מבקר המדינה שיגר אל חלק מהמעורבים טיוטת דוח חמורה ביותר, וביקש את התייחסותם. הדוח הסופי יוגש בתקופה הקרובה. ככל הידוע, צוות הבדיקה מבקש להעביר את הממצאים לידי היועץ המשפטי לממשלה, כדי שישקול פתיחת חקירה פלילית.
דוברת השר ליברמן, אירנה אטינגר, מסרה בתגובה (ציטוט):
השר אביגדור ליברמן הוביל החלטת ממשלה שהתקבלה בתאריך 15.9.03 על הפיכת מע"צ מיחידת סמך לחברה ממשלתית. ההתארגנות המעשית התחילה בתחילת 2004, כאשר ביוני 2004 השר ליברמן עזב את הממשלה ותפקידו כשר תחבורה. ההסכם האחרון עם ההסתדרות שאיפשר את הפעלת מע"צ כחברה ממשלתית נחתם ב-7.7.05.
בשנת 2003 הועסקו במסגרת מע"צ 800 עובדים והיום מועסקים שם כ-270 עובדים בלבד. היקף הפעילות השנה בהשוואה ל-2003 גדלה ועוד תגדל בצורה משמעותית. לכן, כל הטענות כלפי השר אביגדור ליברמן הם ניסיון מגוחך להטיל רפש והאשמות בלתי מבוססות.
לגבי הרשימה מבהיר השר ליברמן כי מעולם לא פגש או הכיר את עו"ד אלכסנדר פנחסוב וגב' יאנה גינזבורג, ולא ידע על קיומם עד לפני פרסום הכתבה. אומנם זה קשה להאמין, אך כנראה שגם השר ליברמן לא מכיר את אלפי הבוחרים והפעילים של מפלגת "ישראל ביתנו". כמו כן, חשוב לציין כי השר ליברמן מעולם לא פנה לאיש בנוגע לעו"ד סימה לוי, עו"ד דנה חכים ועו"ד מירב דימרי.
לגבי מר בוריס אברמוב, מסכים השר ליברמן כי עצם היותו שכן בישוב נוקדים זהו פשע נורא למרות ההשכלה והניסיון הרב שלו. השר ליברמן מדגיש כי אברמוב מעולם לא היה חבר או פעיל בישראל ביתנו.