בשנת 2006 רבע מתלונות לקוחות הבנקים נמצאו מוצדקות. מבין חמשת הבנקים הגדולים, נמצא שיעור התלונות המוצדקות הגבוה ביותר בבנק מזרחי טפחות (31.1%), אחריו בנק דיסקונט (31%), בנק הפועלים (27.4%), הבנק הבינלאומי (23.1%). אחוז התלונות המוצדקות הנמוך ביותר נמצא בבנק לאומי (16.5%).
במהלך השנה החולפות טיפלה מחלקת הפיקוח על הבנקים ב-4,176 תלונות, ו-3,092 פניות לקבלת מידע ובקשות שונות, אשר נובעות במקרים רבים מאי ידיעה של נהלים והוראות בנושאי בנקאות. הפיצוי הכולל ששילמו הבנקים ללקוחות בעקבות הטיפול בתלונות הספציפיות הסתכם בכ-2,300,000 ש"ח. הנושאים המרכזיים בהם עסקו הפניות הם: משכנתאות, ניהול חשבון בנק, שיקים, עמלות ואשראי.
כ.א.ל - במקום הראשון בשיעור התלונות המוצדקות
מבין חברות כרטיסי האשראי, נמצא שיעור התלונות המוצדקות הגבוה ביותר בחברת כ.א.ל - 19.4%, לעומת 14.3% בשנת 2005. אחריה ישראכארט - 12.3%, לעומת 17.6% בשנת 2005. בחברת לאומי קארד לא נמצאו תלונות מוצדקות כלל.
המידע שהגיע לפיקוח על הבנקים במסגרת הטיפול בפניות הציבור וממקורות אחרים, היווה בסיס לטיפול מערכתי בנושאים רבים במהלך 2006, בין היתר, כאלה הקשורים לפירעון מוקדם של הלוואות, דרכי חישוב ריבית, חיוב בעמלות, ועוד. כתוצאה מטיפול בנושאים אלו, נדרשו בנקים, בין היתר, להחזיר כספים לציבור הלקוחות בסכום כולל של כ-13 מיליון ש"ח, הנובע ברובו מהחזר שביצע בנק הפועלים בגין עיגול ריבית הלייבור לשמינית האחוז הקרובה, בלי שניתן על כך גילוי נאות ללקוחות.