ראש המטה הכללי, רב-אלוף גבי אשכנזי, רשם נזיפה פיקודית בעניינו של תת-אלוף יאיר גולן, בעקבות חקירת משטרה צבאית חוקרת שנפתחה בגין מספר מקרים בהם הורה גולן על שימוש ב"נוהל שכן", בניגוד לפקודה שניתנה על-ידי הרמטכ"ל.
"נוהל שכן" הוא תרגולת שהיתה נהוגה בצה"ל ובה לקחו חיילי הכוח אחד מן הפלשתינים בכפר שאליו נכנסו בשל ההנחה כי המחבלים לא ינסו לירות עליהם מחשש שיפגעו בחברם.
לאור חוות דעת הפרקליט הצבאי הראשי ולאחר ששמע את הקצין, החליט הרמטכ"ל לנזוף בו, על שפעל בניגוד לפקודות, ללא יידוע מפקדיו וקבלת אישור לכך. בנוסף, קבע הרמטכ"ל כי קידומו של תת-אלוף יאיר גולן יעוכב לתקופה שלא תפחת מ-9 חודשים (החל ממרץ 2007) וכמו כן, טרם קידומו של תא"ל גולן תתקיים התייעצות נוספת בעניין זה עם הפרקליט הצבאי הראשי.
תת-אלוף גולן ניסה לסנגר על עצמו וציין בפני הרמטכ"ל כי מעשיו, על אף הפסול שבהם, נועדו לסייע לפקודיו לבצע את משימותיהם ולהתמודד עם קושי מבצעי אמיתי, ומתוך כוונה למנוע סיכון חיי אדם ופגיעה ברכוש. עם זאת, לא ביקש להפחית בתיאור אחריותו להוראות שנתן.
הפרקליט הצבאי הראשי, תת-אלוף אביחי מנדלבליט, ציין בחוות הדעת אשר הגיש לרמטכ"ל, כי על מפקד בצה"ל מוטלת החובה לפעול בכל עת בהתאם לדין ולפקודות של מפקדיו המוסמכים, ואין בעובדה שחריגה מן הדין ומן הפקודות הביאה לתוצאה חיובית, כביכול, כדי לגרוע מן הפסול העקרוני שבכך. עם זאת, הפרקליט הצבאי הראשי סבר, כי יש לתת משקל לעובדה שההחלטות שקיבל תת-אלוף יאיר גולן צמצמו בפועל את הסיכון לאוכלוסיה המקומית ולרכושה, ומנעו פגיעה בנפש וברכוש.
כן ציין הפרקליט הצבאי הראשי את העובדה שתת-אלוף גולן הורה להפעיל את נוהל "אזהרה מוקדמת" רק במספר מצומצם ביותר של מקרים, יחסית למספרן הגדול מאוד של פעולות המעצר שבוצעו תחת פיקודו באותה תקופה.
לאחר ששקל את חומרת מעשיו של תת-אלוף גולן, מחד-גיסא, ואת השיקולים המקלים בענינו מאידך-גיסא, מצא הפרקליט הצבאי הראשי כי למרות שמעשהו היה חמור, מדובר בכשל שהוא פיקודי-מקצועי בעקרו, ולפיכך ניתן להסתפק בעניינו של תת-אלוף גולן בצעד פיקודי משמעותי, ללא מיצוי הדין עימו בהליך פלילי.
הרמטכ"ל הדגיש כי על מפקדים בצה"ל בכל הרמות מוטלת החובה בכל עת לפעול בהתאם לדין ולפקודות של מפקדיהם המוסמכים.
