שר הביטחון, אהוד ברק, אמר (יום ה', 11.12.08) כי אין שום קשר בין המאמץ להחזיר את גלעד שליט לבין העברת הכספים מהבנקים ביהודה ושומרון אל הבנקים ברצועת עזה היום. "כרגיל, הדמגוגיה מנצחת אצלנו את העובדות, ואני מתעקש להיות עם העובדות. אני עיכבתי את העברת הכספים ככל שאפשר היה, אבל נגיד בנק ישראל דרש והסביר בהיגיון מדוע חסימת העברת הכספים פוגעת הן במשק הישראלי והן בקשרינו עם הבנק העולמי ועם גורמים פיננסיים בכל העולם. ההחלטה על העברת הכספים התקבלה בפורום ממשלתי ראוי ונכון", אמר ברק.
ברק אמר כי ידע שההחלטה קשה ותגרור ביקורת. הוא התיישר עם הקו הפרסומי של המפלגה, ורמז לכך שבניגוד ליריביו הוא מנהיג. "תפקידם של מנהיגים לקבל החלטות גם כאשר הן קשות וגם כאשר הן נתונות במחלוקת, וצריך לדעת לספוג ביקורת גם כאשר אין התאמה בין הביקורת לבין המציאות", אמר שר הביטחון. "זו עונה פוליטית", הוסיף ברק מעמדת המשקיף. "כולם שולפים מילים מהמותן, בלי תמיד לחשוב על המשמעות האמיתית שלהן, אבל שיקולים פוליטיים עם הצהרות מתלהמות לא עושים עליי רושם. אני פועל לטובת האינטרסים של מדינת ישראל על-פי מיטב שיפוטי המקצועי ועל-פי הכרתי ומצפוני", דברי ברק.
דבריו של ברק נאמרו במלאת 900 יום לחטיפת שליט, בתחילת ישיבת סיעת מפלגת העבודה הערב בבית מפלגת העבודה בתל אביב. אין יום ואין לילה שאני לא חושב מה עוד ניתן לעשות כדי שנחזיר אותו הביתה...אני לא אעשה דבר שיש בו פגיעה, ולו הקלה ביותר, בסיכוי להחזיר את גלעד הביתה במהרה ובשלום", אמר ברק. לדבריו, המחיר לא יהיה קל, ותצטרכנה להתקבל החלטות קשות וכואבות.