האפיפיור בנדיקטוס השישה-עשר פתח את ביקורו בארץ בעלייה להר הצופים בירושלים. ראש העירייה ניר ברקת קיבל את פניו ונשא דברים לכבוד תחילתו של "המסע ההיסטורי לירושלים". ברקת העניק לאפיפיור מפה עתיקה של העולם מהמאה ה-19 בה נראית ירושלים כמרכז העולם.

"בירושלים, בירת ישראל והעם היהודי מקדמים בברכה פלורליזם, הידברות וחופש דת", אמר לו ברקת במסר מדיני מובהק.

בין הדברים שאמר ברקת: "ברוך הבא לירושלים... במהלך שהותך פה, תרגיש בבית, בין חברים החולקים אמונות רבות יחד, בשלום, הרמוניה וחופש. תרגיש בבית כשתנשום את ההיסטוריה העתיקה ואת התרבות המודרנית של ירושלים. ותרגיש בבית משום שגם אתה, הוד קדושתך, שייך לעיר גדולה זו".

ברקת אמר כי הוא רוצה לנצל את ביקורו של האפיפיור כדי לקרוא לכל אדם בעל אמונה "לבקר בירושלים לפחות פעם אחת בחייו".

ברקת הדגיש בדבריו את הסובלנות הקיימת בירושלים בין הדתות השונות ואמר "אנו מקדמים בברכה פלורליזם, הידברות וחופש דת מתוך כבוד הדדי כמאמר הנביא ישעיה: 'וַהֲבִיאוֹתִים אֶל-הַר קָדְשִׁי, וְשִׂמַּחְתִּים בְּבֵית תְּפִלָּתִי--עוֹלֹתֵיהֶם וְזִבְחֵיהֶם לְרָצוֹן, עַל-מִזְבְּחִי: כִּי בֵיתִי, בֵּית-תְּפִלָּה יִקָּרֵא לְכָל-הָעַמִּים'".

מירושלים ייצא האפיפיור למעון שגריר הוותיקן במזרח ירושלים. אחר-הצהריים יגיע בנדיקטוס ה-16 למשכן הנשיא, שם ייפגש עם פרס וגם עם משפחת החייל החטוף גלעד שליט.

מאוחר יותר יגיע האפיפיור לביקור ביד ושם, באוהל יזכור, בנוכחות ניצולי שואה. האפיפיור ישתתף במעמד התייחדות ואזכרה, ישא דברים וכן ילחץ יד לשישה ניצולי שואה ולחסיד אומות העולם.