כארבעה חודשים לאחר שהנשיא צבי גליל אולץ להתפטר מתפקידו, נבחר באוניברסיטת ת"א נשיא חדש ברוב קולות. סנאט אוניברסיטת ת"א אישר (יום ד', 21.10.09) את בחירת פרופ' יוסף קלפטר לנשיאה השמיני של האוניברסיטה. קלפטר, המשמש מאז שנת 2002 כיו"ר ההנהלה של הקרן הלאומית למדע, נבחר ברוב של 213 קולות. 24 מצביעים התנגדו לבחירה, 21 נמנעו ושניים הצביעו בפתק לבן.
רק אתמול הודיע מבקר המדינה,
מיכה לינדנשטראוס, כי הוא מתכוון להרחיב את בדיקתו בפרשת ההדחה של הנשיא הקודם של האוניברסיטה, פרופ' גליל, ולבחון את מעורבותם של חברי הוועד המנהל, ד"ר
ליאורה מרידור ואלפרד אקירוב, בקידום ההליכים להדחתו. המבקר גם מסר כי יבדוק ממצאים הקושרים את מעורבותם של אנשי עסקים נוספים בפעילות הוועד המנהל ואת פעילות מכירת תיק המניות של האוניברסיטה ע"י ד"ר מרידור.
ד"ר מרידור עצמה, שהיא יו"ר הוועד המנהל של האוניברסיטה, ומי שעמדה בראש ועדת האיתור לבחירת מועמד לנשיא חדש לאוניברסיטה, בירכה על החלטת סנאט האוניברסיטה לאשר ברוב גדול את המלצת ועדת האיתור המיוחדת.
מרידור ציינה כי פרופ' קלפטר הינו מינוי מצויין ולדבריה הוא עתיד להוביל את האוניברסיטה לדרך חדשה שתאופיין במנהיגות ניהולית-אקדמית משובחת.
"בחירתו של פרופ' קלפטר על-ידי אנשי הסגל מבהירה כי חברי הסגל משוועים כעת לדרך מנהיגותית חדשה, אשר תוביל את המוסד האקדמי הגדול בישראל בתקופה מאתגרת כלכלית זו", אמרה מרידור. "על פרופ' קלפטר מוטלת כעת החובה לאחד סביבו את כלל הגופים הרוצים בטובתה של האוניברסיטה ולדאוג כי אלה יפעלו יחד עימו, להצעיד את האוניברסיטה למקומה ההולם. בטוחני כי לפרופ' קלפטר יש החזון, היכולות הנידרשות והאישיות המתאימה להצליח במשימה החשובה: קביעת פניה של אוניברסיטת תל אביב לעשור הקרוב".
שחר בוצר, יו"ר אגודת הסטודנטים באוניברסיטת תל אביב, אמר בתגובה על המינוי כי "אוניברסיטת ת"א עברה בחודשים האחרונים את אחת התקופות הקשות בתולדותיה. כולנו תקווה כי בחירת הנשיא תהווה פתיחתו של עידן חדש עבור הקהילה האקדמית כולה - סגל בכיר, סגל זוטר, סגל מנהלי וסטודנטים כאחד. אנו הסטודנטים מברכים את פרופ' קלפטר לרגל בחירתו, הצלחתו היא הצלחת האוניברסיטה. כולי תקווה כי הנשיא החדש ידגול במדיניות של שיתוף ציבור הסטודנטים בתהליך קבלת ההחלטות במוסד".