נשיא המדינה,שמעון פרס, אמר (יום א',13.12.09) כי הצתת המסגד בשומרון ביום שישי היא אחד הניסיונות הנוראיים ביותר להצתת אש במזרח התיכון.

"שלשום היינו עדים לאחד הניסיונות הנוראיים ביותר להצית אש בסביבתנו. כל המדינה צריכה להתייצב נגד הניסיון הנורא הזה ועליכם מוטלת המשימה הגדולה הזו", אמר לנציגי משטרת ישראל שעמם הדליק נר שלישי של חנוכה.

לדברי הנשיא,אם לא נכבד את דתות זולתנו, איש לא יכבד את דתנו אנו.

הנשיא התייחס גם לגילויי הסרבנות וציין כי אם לא יהיה לישראל צבא אחד המקבל את הוראותיו ממקור אחד, והבנוי על שרשרת פיקוד שאין בה שניות - לא תהיה אפשרות להתקדם כעם.

"אם לא תהיה לנו משטרה היונקת מהסמכות הנבחרת וחוקי המדינה, ופועלת בהיררכיה חד-משמעית, המדינה תיחלש לנקודה שבה כל דאלים גבר, והחרבות יכתתו את האתים", טען.