הרב הראשי לישראל יונה מצגר רמז כי ייתכן שפלשתינים הם העומדים מאחורי הצתת המסגד בכפר יאסוף. בראיון לגלי צה"ל, לאחר ביקורו בכפר, סיפר כי כוחות הביטחון אמרו לו שהפלשתינים ניקו מהר את המקום מבלי שניתנה אפשרות לצה"ל לחקור מיהו העומד מאחורי ההצתה.

"כוחות הביטחון סיפרו לי שהמבנה שוקם במהירות ומבלי שניתנה להם האפשרות לחקור את האירוע, מי יודע, אני לא בטוח שזה נעשה דווקא על-ידי אותם גורמים שאומרים עליהם שהם קיצוניים", אמר.

את הרב אבטחו אנשי ביטחון פלשתינים בת, בעוד כוחות הביטחון הישראלים כלל לא נכנסו לכפר. ליווה אותו מושל סלפית. הרב מצגר אמר כי אין להפוך את המאבק הלאומי למאבק דתי, והביע תקווה שביקורו יכבה את השריפה שניצתה. לדבריו, טרם נתפס המצית ואין לעשות הכללות ולכנות את כל המתנחלים "פושעים ושורפי מסגדים". לפני הביקור נכנס לכפר כוח של צה"ל, וביציאה משם נרגם באבנים.

אתמול לא אפשר צה"ל למשלחת רבנים מן הציונות הדתית בראשות הרב מנחם פרומן להיכנס לתוך הכפר, בטענה שמדובר ב"שטח צבאי סגור", והמשלחת נועדה עם נכבדי הכפר הפלשתינים בצומת תפוח, והביאה עימה ספרי קוראן כתרומה למסגד במקום אלו שניזוקו בשריפה.

הרב מצגר אמר עוד היום כי בעת שחיילים נמצאים בידי מפקדיהם, המפקדים הם כמו הרבנים שלהם. הוא סבור כי אסור לסרב לפקודה, אך מנגד על המפקדים להשכיל שלא להעמיד אותם במצבים בעייתיים. הרב סבור עוד כי לא נכון שהישיבה כולה ותלמידיה יסבלו בגלל דברים שאומר העומד בראשה. בקול ישראל דווח כי לפני כשבוע נפגש הרב מצגר עם הרב אליעזר מלמד בניסיון להביא לפשרה בינו לבין שר הביטחון אהוד ברק, ללא הועיל. מועצת הרבנות הראשית שוקלת לקיים ישיבה שלא מן המניין בעקבות ביטול ההסדר עם ישיבת הר ברכה.