שר הביטחון, אהוד ברק, התייחס לראשונה לפרשת המסמך המפוברק והאשים כי קצינים בכירים בסדיר ובמילואים היו מעורבים בניסיון לסכל את הליך מינוי הרמטכ"ל הבא.

"אני מברך על החקירה המהירה של משטרת ישראל ועל הגעתה למסקנות. יחד עם זאת, אני מודאג מהניסיון שנעשה ע"י מספר קצינים בכירים בסדיר ובמילואים, לעצור ולדחות את תהליך מינוי הרמטכ"ל הבא, ולהשפיע באופן לא לגיטימי על תוצאותיו. הניסיון כמעט וצלח. זהו מהלך נפסד שטלטל את המדינה כולה במשך כמה שבועות - וגרם נזק עמוק לאמון הציבור בצה"ל", אמר (יום ה', 2.9.10) בפורום המטה הכללי בדיון חגיגי שהתקיים לקראת השנה החדשה.

לדברי ברק, מדובר במקרה אינו פשוט אשר משאיר סימני שאלה רבים וקשים, גם לאחר שהמשטרה סיימה את חקירתה. "הוא מהווה תמרור אזהרה למי שחפץ בחיים במדינה דמוקרטית, שבה הדרג הצבאי כפוף לדרג המדיני", טען.

שר הביטחון הודיע כי בכוונתו למנות צוות בראשות האלוף (במיל.) יצחק בריק על-מנת שימליץ בהקדם על הצעדים שיש לנקוט, בעקבות מה שעלה מההתרחשויות כדי להבטיח שדברים כאלה לא יישנו.

"חוק יסוד הצבא הוא הקצר ביותר בספר החוקים שלנו. מצוין בו שצה"ל יגן על מדינת ישראל, שהרמטכ"ל הוא הדרג הפיקודי העליון בצבא, שצה"ל נתון למרותה של הממשלה ושהרמטכ"ל כפוף לשר הביטחון. על הדברים הפשוטים הללו, שהם יסוד הדמוקרטיה, בכוונתי לעמוד באופן נחרץ והחלטי", הדגיש.