שוויה של בז"ן נאמד ב- 2.1 עד 2.2 מיליארד שקל - כך נקבע על-ידי כלכלנים שביצעו הערכות שווי לחברה לקראת פיצולה עם תום הזיכיון באוקטובר 2003.
תוך שישה חודשים תפוצל בז"ן לשני בתי זיקוק נפרדים, בחיפה ובאשדוד, שאמורים להתחרות ביניהם. זאת, כשלב הראשון לקראת הפרטתה המלאה, שאמורה להתבצע בתוך 18 חודשים.
החברה לישראל, המחזיקה 26% ממניות בז"ן, יכולה לבחור בין שתי אופציות לאחר פיצולה של בז"ן: למכור למדינה את אחזקותיה בבז"ן, או לרכוש את אחד מבתי הזיקוק.
פרופ' יצחק סוארי, שערך את הערכת השווי של בתי זיקוקו לנפט (בז"ן) עבור החברה לישראל, מעריך את שוויה של בז"ן ב-2,234 מיליון שקל.
רן קרול, שביצע את הערכת השווי עבור המדינה מעריך את שוויה של בז"ן ב-2,143 מיליון שקל.