חומר הראיות מאפשר להעמיד לדין את מדינת ישראל בגין רצח בכוונה תחילה, התעללות וגרימת סבל ופגיעה במתכוון. כך קובעת ועדת הבדיקה המיוחדת שהוקמה מטעם מועצת זכויות האדם של האו"ם, כדי לחקור את פרשת המשט שבעיצומה השתלטו כוחות צה"ל על ספינת המרמרה. בהשתלטות נהרגו תשעה מפעילי המשט שניסו לפרוץ את המצור על רצועת עזה ונפצעו עשרות נוספים.

דוח ועדת הבדיקה נערך למרות התנגדות ישראל, שנמנעה מלשתף פעולה עם הוועדה. טענת ישראל: ישראל חוקרת בעצמה, גם באמצעות ועדת טירקל, את אירועי המשט, ועל-כן אין מקום לוועדת בדיקה מטעם מועצת זכויות האדם.

בפרק המסקנות קובעת הוועדה, כי הפעולה הישראלית שנועדה למנוע מספינות המשט לפרוץ את המצור על רצועת עזה הינה הפרה בוטה של זכויות אדם והחוק הבינלאומי. חברי הוועדה ממליצים לפעול נגד ישראל ולהאשימה באחריות לפעולה ולתוצאותיה. במקביל ממליצה הוועדה לחייב את ישראל לשלם פיצויים למשפחות ההרוגים ולנפגעים הרבים.

בדוח הוועדה נקבע עוד, כי ישראל פעלה באופן בלתי מידתי, כאשר הזרימה כוחות גדולים לספינה ואלה השתמשו באלימות רבה ובלתי נחוצה ובנשק חם כדי לעצור את הספינה.

מחברי הדוח כותבים מפורשות, כי מחומר הראיות שנאסף עולות ראיות לכך שישראל ביצעה עבירות חמורות על החוק הבינלאומי ולכן וניתן להגיש נגדה אישומים בבית הדין הבינלאומי. מחברי הדוח מייחסים לממשלת ישראל בכלל ולכוחות הביטחון בפרט חריגה מסעיפים יסודיים בחוק הבינלאומי, לרבות: פגיעה בזכות לחיות, עינויים, מעצרים בלתי חוקיים ושרירותיים ומניעת חופש ביטוי.

תגובת ישראל לדוח ועדת הבדיקה

ישראל הרשמית מותחת ביקורת על החלטת הוועדה. "כמצופה ממדינה דמוקרטית - ישראל חקרה ועדיין חוקרת את אירועי המשט.ועדת הבדיקה של צה"ל בראשות האלוף (מיל.) גיורא איילנד סיימה את עבודתה", נאמר בהודעת משרד החוץ. "ועדת טירקל בה חברים גם שני משקיפים בינלאומיים עדיין עובדת. באופן חסר תקדים הסכימה ישראל גם להשתתף בוועדת חקירה של מזכ"ל האו"ם, הבוחנת אף היא את הנושא. הדוח שפורסם היום הוא מוטה וחד-צדדי בדיוק כמו הגוף שילד אותו. לאור כל זאת, ישראל סבורה שאירועי המשט כבר נחקרים בהיקף מספיק, וכל עיסוק נוסף בנושא הינו מיותר לחלוטין ואינו פרודוקטיבי".