על משרד החינוך להודיע בתוך שלושה חודשים לבג"ץ, מדוע אינו מקיים מבחני מיצ"ב במוסדות החינוך החרדיים. כך קבעו (יום ה', 22.3.12) הנשיאה בדימוס דורית ביניש והשופטים מרים נאור ועוזי פוגלמן.

בג"ץ פרסם פסק דין חלקי בעתירת התנועה הרפורמית, אשר ביקשה לחייב את משרד החינוך לוודא את קיומם של לימודי הליבה במוסדות החינוך החרדיים, כפי שכבר הורה בג"ץ. הבקשה הייתה, שמשרד החינוך "יקים ויפעיל לאלתר מנגנון פיקוח יעיל, המתוקצב בהתאם על מוסדות החינוך המוכרים שאינם רשמיים ומוסדות הפטור, יסודיים ועל-יסודיים, תוך הקצאת תקני מפקחים בכמות ראויה וקיום בדיקה סדירה של עמידת כלל המוסדות בתנאי הדין".

בג"ץ קבע, כי כרגע אין מקום להתערבותו בנושא הליבה, "נוכח תהליך נמשך של תגבור והעצמת הפיקוח מצידו של המשיב". על-פי נתוני משרד החינוך, בשנת הלימודים תשע"א כבר היו 27 מפקחים על מוסדות החינוך החרדיים, והשנה מאוישים 15 תקנים נוספים. השופטים מדגישים: "נוכח תהליך העמקת הפיקוח, שהמשיב רואה עצמו מחויב להמשיך בו, והודעת המשיב כי עם השלמת המהלך, יעמוד מספר המפקחים היחסי על שיעור דומה לזה הקיים בחינוך הממלכתי, הנחתנו היא כי המהלך יימשך ויושלם במהירות הראויה".

עוד מסר משרד החינוך, כי בשנת הלימודים תשע"א הופחתו התקציבים למוסדות החינוך העצמאי ובית יעקב (של אגודת ישראל) ומעיין החינוך התורני (של ש"ס) ב-21 מיליון שקל, והשנה הופחתו 15 מיליון שקל נוספים. זאת, לנוכח ממצאי הפיקוח בנוגע למידת השילוב של לימודי הליבה במוסדות אלו.