הסיבוב השני בבחירות לנשיאות מצרים החל (יום שבת, 16.6.12), כאשר 50 מיליון אזרחים מצרים יצאו לקלפיות כדי להכריע מי יהיה הנשיא הבא מבין שני המועמדים: מוחמד מורסי או אחמד שאפיק.
מורסי הינו מועמד מטעם האחים המוסלמים, בעוד ששאפיק היה ראש הממשלה בעת כהונת הנשיא המודח,
חוסני מובארק.
הבחירות במצרים נערכות בצל החלטת בית המשפט העליון לפזר את הבית התחתון בפרלמנט, שבו היה לאחים המוסלמים שליטה מוחלטת, ולקיים בחירות מחדש.
ראש המועצה הצבאית העליונה של מצרים, הגנרל חוסין טנטאווי, אישר במוצאי שבת את החלטת בית המשפט החוקתי במדינה והורה לפזר את הבית התחתון של הפרלמנט. האחים המוסלמים מחו מצידם על הצעד, וקראו לקיים משאל עם בנושא.
בית המשפט גם אפשר לשאפיק להתמודד בסיבוב השני בבחירות, וקבע כי מועמדותו לא תיפסל בשל חוק הצינון שנקבע בפרלמנט אשר קבע כי מי שהיה שותף בממשל מובארק לא יכול להשתתף בבחירות במשך עשר שנים.
בית המשפט קבע כי חוק הצינון אינו חוקתי ועל-כן איפשר לשאפיק להתמודד מול מועמד האחים המוסלמים לנשיאות.
החלטת בית המשפט העליון עוררה זעם רב. אלפי מפגינים יצאו ביום שישי (15.6.12) להפגנות ברחובות קהיר ואלכסנדריה, נגד פסיקת בית המשפט העליון במדינה - הנתפסת כניסיון מחושב לתפוס מחדש את השלטון על-ידי שרידי המשטר הישן.
לאור המתיחות במדינה, מתקיימות הבחירות חחת אבטחה כבדה מאוד. על-פי הערכות, כ-200 אלף שוטרים ו-200 אלף חיילים יאבטחו את הרחובות והקלפיות בבחירות שיימשכו גם היום (א', 17.6.12). תוצאות ההצבעה יודעו בעוד כשבוע.