בהסכם עד המדינה שנחתם עם ש"ד לא נכללה פרשת תעשיות מלח, בה נטען שדני דנקנר שילם באמצעות ש"ד ומאיר רבין שוחד ליעקב אפרתי תמורת שינוי הייעוד של קרקעות החברה באילת ובעתלית. לדברי ש"ד (יום א', 9.9.12) בסיום חקירתו הראשית, לאחר אחת מחקירותיו ראה אדם עובר בגבו אליו ולא זיהה אותו, ורק למחרת ראה בעיתון את תמונתו של דנקנר בצמוד לידיעה על חקירתו.

ש"ד העיד, כי בשנת 2003 אמר לו רבין, כי סיכם עם דנקנר שיקבל ממנו 250,000 שקל, לנוכח הסיוע שהעניק לו מול המינהל בהשגת הסכם להפשרת הקרקעות. רבין הועסק אז בחברת ש.א.ד שבבעלות ש"ד. "הגבתי קשה מאוד, כי עד אותו רגע של הוצאת החשבונית [של ש.א.ד לתעשיות מלח] לא ידעתי כלום, ומאיר לא סיפר לי שהוא עובד על הנושא הזה", טען. "מאיר אמר לי שחלק מהכסף מיועד לדודו [אפרתי] תמורת העזרה שהוא מגיש לדנקנר". השופט דוד רוזן: "איפה העמלה שלכם?" ש"ד: "אותו הזמן לא דובר כמה יועבר וכמה לא". רוזן: "זה הדבר היחיד שצריך לעניין אותך. מה, מעניין אותך הפיתוח של עתלית?" ש"ד: "באותו שלב זה לא עניין אותי. לא ידעתי שיהיה לזה המשך. אף פעם לא היו חילוקי דעות ביני לבין מאיר". רוזן: "כמה חשבת שיגיע אליך?" ש"ד: "רבע, חצי, משהו כזה".

בשלב מאוחר יותר הורה רבין להוציא חשבונית בסך 1.35 מיליון שקל לטובת תעשיות מלח, אך ש"ד הורה לבטל אותה ונזף ברבין. "הוא אמר לי שהגיע להסדר עם דנקנר על המשך תשלומים. התריתי בו שלא יעשה את זה יותר, ואם וכאשר יגיע הכסף - אז שידבר אתי על הוצאת חשבונית. לא האמנתי לו שיגיע כסף. מאיר הוא בחור מאוד אופטימי, הוא היה בטוח שהכסף יתקבל". ש"ד העיד בפירוט על חשבוניות שהוצאו בהמשך, כאשר הכספים אכן התקבלו. בסך-הכל קיבלה ש.א.ד 250,000 שקל ועוד 200,000 דולר. מתוך סכום זה, העביר ש"ד לבקשת רבין לשלמה בן-עמר, דודו של רבין, ועוד 250,000 שקל נתן לרבין שיחליט כמה מתוכם ייתן לאפרתי.

"אותך לא עניין כמה הוא נותן לאפרתי? מה זה, עניין משפחתי? צנעת הפרט?" שאל רוזן. ש"ד השיב, כי היה הסדר בינו לבין רבין, לפיו לא התערב בעבודותיו הפרטיות של רבין. הוא גם היה אדיש להעברת הכסף לבן-עמר, שכן ממילא רוב הכסף הגיע לרבין. בידי ש"ד נותרו לאחר ההעברות 700,000 שקל ברוטו. "רבין אמר לי שלאפרתי יש חשיבות מכרעת לשינוי הייעוד, כי המנהל הקודם של המינהל, מבקר המדינה והיועץ המשפטי לממשלה התנגדו לכך. ההתערבות שלו נחשבה למקצועית ולא לפוליטית ולכן חשיבותו הייתה מכרעת", הוסיף ש"ד.