מבקר המדינה הנכנס, יוסף שפירא, החליט לאפשר לקודמו, השופט (בדימ.) מיכה לינדנשטראוס, להגיש את דוח הרפז עד 3 באוקטובר - הוא המועד האחרון שנקבע בהתבסס על התיקון לחוק, המאפשר למבקר היוצא להגיש את הדוח עד שלושה חודשים מעת סיום כהונתו.

הדוח צפוי להתפרסם מייד לאחר חג הסוכות, לאחר שיבוצעו ההשלמות הנדרשות ותושלם עריכתו הסופית. מניעת פרסומו של הדוח תיתכן רק בצו שיפוטי, אם וכאשר יפנה אחד המבוקרים לבית המשפטואם כאמור תתקבל בקשתו לעצור פרסום הדוח.

ל-News1 נודע, כי המבקר שפירא החליט בינו-לבינו להימנע מכל עיסוק פרטני בדוח הרפז וזאת, בין היתר, כדי למנוע עיכוב ממושך נוסף בגיבושו של הדוח. שפירא מסר למקורביו, כי במתכוון - הוא מדיר עצמו כמעט מכל עיסוק בנושא, מתוך מגמה לאפשר ללינדנשטראוס להגיש את הדוח ולהסירו מסדר יומו של משרד מבקר המדינה. עם זאת, יתן המבקר גיבוי ויאשרו כדוח מבקר המדינה.

שפירא נמנע מ"הכנסת ראשו" לפרשה זו, שנחקרה במשך כשנתיים על-ידי המבקר הקודם וצוותו. המבקר רואה חשיבות מיוחדת שלינדנשטראוס הוא שיגיש את הדוח, גם בשל זאת שלינדנשטראוס הוא שערך אישית שימועים לאישים המבוקרים, ושימועים, כידוע, דינם כדין עדות הניתנת בפני שופט.

דוח מבקר המדינה בפרשת הרפז כולל ביקורת חריפה על שורה של אישים, ובראשם: הרמטכ"ל היוצא גבי אשכנזי ואלוף משנה ארז וינר, ונגד שר הביטחון אהוד ברק. המבקר היוצא כבר הביע עמדתו בפני היועץ המשפטי לממשלה, יהודה וינשטיין, לפיה יש להורות על חקירה משטרתית בפרשה.

הטיוטא הסופית שוגרה למבוקרים ביום 13.09.12 ואלה התבקשו ליתן תגובתם עד יום 27.09.12. למבקר היוצא יוותרו כשבעה ימים בלבד לגיבושו הסופי של הדוח ולהגשתו הרשמית לציבור.